Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMX5

NENF, Neudesin, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NENFQ9UMX5 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NENFQ9UMX5 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NENFQ9UMX5 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NENFQ9UMX5 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NENFQ9UMX5 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NENFQ9UMX5 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NENFQ9UMX5 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NENFQ9UMX5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NENFQ9UMX5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NENFQ9UMX5 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NENFQ9UMX5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NENFQ9UMX5 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NENFQ9UMX5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NENFQ9UMX5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NENFQ9UMX5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NENFQ9UMX5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NENFQ9UMX5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NENFQ9UMX5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NENFQ9UMX5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NENFQ9UMX5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NENFQ9UMX5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NENFQ9UMX5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NENFQ9UMX5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NENFQ9UMX5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NENFQ9UMX5 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NENFQ9UMX5 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NENFQ9UMX5 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NENFQ9UMX5 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NENFQ9UMX5 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NENFQ9UMX5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NENFQ9UMX5 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NENFQ9UMX5 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NENFQ9UMX5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NENFQ9UMX5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NENFQ9UMX5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NENFQ9UMX5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NENFQ9UMX5 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NENFQ9UMX5 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NENFQ9UMX5 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NENFQ9UMX5 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NENFQ9UMX5 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NENFQ9UMX5 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NENFQ9UMX5 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NENFQ9UMX5 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NENFQ9UMX5 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NENFQ9UMX5 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NENFQ9UMX5 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NENFQ9UMX5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NENFQ9UMX5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NENFQ9UMX5 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NENFQ9UMX5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NENFQ9UMX5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NENFQ9UMX5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NENFQ9UMX5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NENFQ9UMX5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NENFQ9UMX5 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NENFQ9UMX5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NENFQ9UMX5 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NENFQ9UMX5 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NENFQ9UMX5 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NENFQ9UMX5 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NENFQ9UMX5 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NENFQ9UMX5 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NENFQ9UMX5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NENFQ9UMX5 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NENFQ9UMX5 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NENFQ9UMX5 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NENFQ9UMX5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NENFQ9UMX5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NENFQ9UMX5 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NENFQ9UMX5 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NENFQ9UMX5 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NENFQ9UMX5 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NENFQ9UMX5 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NENFQ9UMX5 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NENFQ9UMX5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NENFQ9UMX5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NENFQ9UMX5 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NENFQ9UMX5 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NENFQ9UMX5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NENFQ9UMX5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NENFQ9UMX5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NENFQ9UMX5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NENFQ9UMX5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NENFQ9UMX5 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NENFQ9UMX5 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NENFQ9UMX5 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NENFQ9UMX5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NENFQ9UMX5 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NENFQ9UMX5 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NENFQ9UMX5 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NENFQ9UMX5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NENFQ9UMX5 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NENFQ9UMX5 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NENFQ9UMX5 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NENFQ9UMX5 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NENFQ9UMX5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NENFQ9UMX5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NENFQ9UMX5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NENFQ9UMX5 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms