Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS6

SYNPO2, Synaptopodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2Q9UMS6 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYNPO2Q9UMS6 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYNPO2Q9UMS6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYNPO2Q9UMS6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYNPO2Q9UMS6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYNPO2Q9UMS6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYNPO2Q9UMS6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYNPO2Q9UMS6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYNPO2Q9UMS6 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYNPO2Q9UMS6 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYNPO2Q9UMS6 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SYNPO2Q9UMS6 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SYNPO2Q9UMS6 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYNPO2Q9UMS6 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYNPO2Q9UMS6 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYNPO2Q9UMS6 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYNPO2Q9UMS6 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SYNPO2Q9UMS6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SYNPO2Q9UMS6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYNPO2Q9UMS6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYNPO2Q9UMS6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYNPO2Q9UMS6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYNPO2Q9UMS6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYNPO2Q9UMS6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYNPO2Q9UMS6 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYNPO2Q9UMS6 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYNPO2Q9UMS6 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SYNPO2Q9UMS6 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYNPO2Q9UMS6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYNPO2Q9UMS6 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYNPO2Q9UMS6 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYNPO2Q9UMS6 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYNPO2Q9UMS6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYNPO2Q9UMS6 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYNPO2Q9UMS6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYNPO2Q9UMS6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYNPO2Q9UMS6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYNPO2Q9UMS6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYNPO2Q9UMS6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYNPO2Q9UMS6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYNPO2Q9UMS6 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYNPO2Q9UMS6 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYNPO2Q9UMS6 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYNPO2Q9UMS6 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SYNPO2Q9UMS6 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYNPO2Q9UMS6 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SYNPO2Q9UMS6 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYNPO2Q9UMS6 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYNPO2Q9UMS6 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYNPO2Q9UMS6 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SYNPO2Q9UMS6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYNPO2Q9UMS6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYNPO2Q9UMS6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYNPO2Q9UMS6 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYNPO2Q9UMS6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYNPO2Q9UMS6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYNPO2Q9UMS6 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYNPO2Q9UMS6 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SYNPO2Q9UMS6 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYNPO2Q9UMS6 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYNPO2Q9UMS6 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SYNPO2Q9UMS6 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYNPO2Q9UMS6 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYNPO2Q9UMS6 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SYNPO2Q9UMS6 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SYNPO2Q9UMS6 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SYNPO2Q9UMS6 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYNPO2Q9UMS6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYNPO2Q9UMS6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SYNPO2Q9UMS6 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SYNPO2Q9UMS6 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYNPO2Q9UMS6 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNPO2Q9UMS6 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNPO2Q9UMS6 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNPO2Q9UMS6 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNPO2Q9UMS6 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNPO2Q9UMS6 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNPO2Q9UMS6 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNPO2Q9UMS6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNPO2Q9UMS6 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNPO2Q9UMS6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNPO2Q9UMS6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNPO2Q9UMS6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SYNPO2Q9UMS6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SYNPO2Q9UMS6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNPO2Q9UMS6 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNPO2Q9UMS6 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNPO2Q9UMS6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNPO2Q9UMS6 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNPO2Q9UMS6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNPO2Q9UMS6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNPO2Q9UMS6 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNPO2Q9UMS6 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNPO2Q9UMS6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNPO2Q9UMS6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNPO2Q9UMS6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNPO2Q9UMS6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNPO2Q9UMS6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNPO2Q9UMS6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNPO2Q9UMS6 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms