Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULW8

PADI3, Protein-arginine deiminase type-3, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI3Q9ULW8 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PADI3Q9ULW8 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PADI3Q9ULW8 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PADI3Q9ULW8 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PADI3Q9ULW8 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PADI3Q9ULW8 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PADI3Q9ULW8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PADI3Q9ULW8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PADI3Q9ULW8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PADI3Q9ULW8 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PADI3Q9ULW8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PADI3Q9ULW8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PADI3Q9ULW8 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PADI3Q9ULW8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PADI3Q9ULW8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PADI3Q9ULW8 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PADI3Q9ULW8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PADI3Q9ULW8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PADI3Q9ULW8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PADI3Q9ULW8 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PADI3Q9ULW8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PADI3Q9ULW8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PADI3Q9ULW8 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PADI3Q9ULW8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PADI3Q9ULW8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PADI3Q9ULW8 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PADI3Q9ULW8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PADI3Q9ULW8 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PADI3Q9ULW8 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PADI3Q9ULW8 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PADI3Q9ULW8 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PADI3Q9ULW8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PADI3Q9ULW8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PADI3Q9ULW8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PADI3Q9ULW8 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PADI3Q9ULW8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PADI3Q9ULW8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PADI3Q9ULW8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PADI3Q9ULW8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PADI3Q9ULW8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PADI3Q9ULW8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PADI3Q9ULW8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PADI3Q9ULW8 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PADI3Q9ULW8 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PADI3Q9ULW8 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PADI3Q9ULW8 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PADI3Q9ULW8 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PADI3Q9ULW8 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PADI3Q9ULW8 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PADI3Q9ULW8 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PADI3Q9ULW8 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PADI3Q9ULW8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PADI3Q9ULW8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PADI3Q9ULW8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PADI3Q9ULW8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PADI3Q9ULW8 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PADI3Q9ULW8 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PADI3Q9ULW8 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PADI3Q9ULW8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PADI3Q9ULW8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PADI3Q9ULW8 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PADI3Q9ULW8 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PADI3Q9ULW8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PADI3Q9ULW8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PADI3Q9ULW8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PADI3Q9ULW8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PADI3Q9ULW8 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PADI3Q9ULW8 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PADI3Q9ULW8 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PADI3Q9ULW8 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PADI3Q9ULW8 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PADI3Q9ULW8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PADI3Q9ULW8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PADI3Q9ULW8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PADI3Q9ULW8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PADI3Q9ULW8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PADI3Q9ULW8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PADI3Q9ULW8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PADI3Q9ULW8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PADI3Q9ULW8 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PADI3Q9ULW8 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PADI3Q9ULW8 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PADI3Q9ULW8 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PADI3Q9ULW8 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PADI3Q9ULW8 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PADI3Q9ULW8 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PADI3Q9ULW8 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PADI3Q9ULW8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PADI3Q9ULW8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PADI3Q9ULW8 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PADI3Q9ULW8 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PADI3Q9ULW8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PADI3Q9ULW8 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PADI3Q9ULW8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PADI3Q9ULW8 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PADI3Q9ULW8 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PADI3Q9ULW8 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PADI3Q9ULW8 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PADI3Q9ULW8 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PADI3Q9ULW8 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms