Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MED23Q9ULK4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MED23Q9ULK4 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MED23Q9ULK4 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MED23Q9ULK4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MED23Q9ULK4 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MED23Q9ULK4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MED23Q9ULK4 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MED23Q9ULK4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
MED23Q9ULK4 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MED23Q9ULK4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MED23Q9ULK4 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MED23Q9ULK4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MED23Q9ULK4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MED23Q9ULK4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MED23Q9ULK4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MED23Q9ULK4 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MED23Q9ULK4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MED23Q9ULK4 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
MED23Q9ULK4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MED23Q9ULK4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MED23Q9ULK4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MED23Q9ULK4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MED23Q9ULK4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MED23Q9ULK4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MED23Q9ULK4 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
MED23Q9ULK4 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
MED23Q9ULK4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MED23Q9ULK4 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MED23Q9ULK4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MED23Q9ULK4 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MED23Q9ULK4 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
MED23Q9ULK4 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MED23Q9ULK4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MED23Q9ULK4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MED23Q9ULK4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MED23Q9ULK4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MED23Q9ULK4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MED23Q9ULK4 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MED23Q9ULK4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MED23Q9ULK4 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MED23Q9ULK4 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MED23Q9ULK4 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MED23Q9ULK4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MED23Q9ULK4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MED23Q9ULK4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
MED23Q9ULK4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MED23Q9ULK4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
MED23Q9ULK4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MED23Q9ULK4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MED23Q9ULK4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MED23Q9ULK4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MED23Q9ULK4 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
MED23Q9ULK4 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MED23Q9ULK4 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MED23Q9ULK4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MED23Q9ULK4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MED23Q9ULK4 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MED23Q9ULK4 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
MED23Q9ULK4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MED23Q9ULK4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MED23Q9ULK4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MED23Q9ULK4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MED23Q9ULK4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MED23Q9ULK4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MED23Q9ULK4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
MED23Q9ULK4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MED23Q9ULK4 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
MED23Q9ULK4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
MED23Q9ULK4 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
MED23Q9ULK4 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
MED23Q9ULK4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MED23Q9ULK4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MED23Q9ULK4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MED23Q9ULK4 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MED23Q9ULK4 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MED23Q9ULK4 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MED23Q9ULK4 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
MED23Q9ULK4 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MED23Q9ULK4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MED23Q9ULK4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
MED23Q9ULK4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MED23Q9ULK4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MED23Q9ULK4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MED23Q9ULK4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MED23Q9ULK4 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MED23Q9ULK4 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MED23Q9ULK4 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MED23Q9ULK4 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MED23Q9ULK4 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
MED23Q9ULK4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MED23Q9ULK4 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MED23Q9ULK4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MED23Q9ULK4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MED23Q9ULK4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MED23Q9ULK4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MED23Q9ULK4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MED23Q9ULK4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MED23Q9ULK4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MED23Q9ULK4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms