Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
NRXN1Q9ULB1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
NRXN1Q9ULB1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
NRXN1Q9ULB1 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
NRXN1Q9ULB1 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
NRXN1Q9ULB1 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
NRXN1Q9ULB1 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
NRXN1Q9ULB1 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
NRXN1Q9ULB1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
NRXN1Q9ULB1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
NRXN1Q9ULB1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NRXN1Q9ULB1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NRXN1Q9ULB1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NRXN1Q9ULB1 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NRXN1Q9ULB1 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
NRXN1Q9ULB1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
NRXN1Q9ULB1 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NRXN1Q9ULB1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NRXN1Q9ULB1 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
NRXN1Q9ULB1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NRXN1Q9ULB1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
NRXN1Q9ULB1 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
NRXN1Q9ULB1 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NRXN1Q9ULB1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NRXN1Q9ULB1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NRXN1Q9ULB1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NRXN1Q9ULB1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NRXN1Q9ULB1 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
NRXN1Q9ULB1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
NRXN1Q9ULB1 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
NRXN1Q9ULB1 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
NRXN1Q9ULB1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
NRXN1Q9ULB1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
NRXN1Q9ULB1 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NRXN1Q9ULB1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NRXN1Q9ULB1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
NRXN1Q9ULB1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
NRXN1Q9ULB1 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
NRXN1Q9ULB1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NRXN1Q9ULB1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NRXN1Q9ULB1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NRXN1Q9ULB1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NRXN1Q9ULB1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NRXN1Q9ULB1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
NRXN1Q9ULB1 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC30.29■■■□□ 2.44
NRXN1Q9ULB1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NRXN1Q9ULB1 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
NRXN1Q9ULB1 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
NRXN1Q9ULB1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
NRXN1Q9ULB1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
NRXN1Q9ULB1 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
NRXN1Q9ULB1 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
NRXN1Q9ULB1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
NRXN1Q9ULB1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
NRXN1Q9ULB1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
NRXN1Q9ULB1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
NRXN1Q9ULB1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
NRXN1Q9ULB1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
NRXN1Q9ULB1 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
NRXN1Q9ULB1 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
NRXN1Q9ULB1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
NRXN1Q9ULB1 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
NRXN1Q9ULB1 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
NRXN1Q9ULB1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
NRXN1Q9ULB1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
NRXN1Q9ULB1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC30.26■■■□□ 2.44
NRXN1Q9ULB1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
NRXN1Q9ULB1 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC30.26■■■□□ 2.44
NRXN1Q9ULB1 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
NRXN1Q9ULB1 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
NRXN1Q9ULB1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
NRXN1Q9ULB1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
NRXN1Q9ULB1 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
NRXN1Q9ULB1 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
NRXN1Q9ULB1 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
NRXN1Q9ULB1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NRXN1Q9ULB1 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
NRXN1Q9ULB1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
NRXN1Q9ULB1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
NRXN1Q9ULB1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
NRXN1Q9ULB1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NRXN1Q9ULB1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NRXN1Q9ULB1 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
NRXN1Q9ULB1 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
NRXN1Q9ULB1 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NRXN1Q9ULB1 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
NRXN1Q9ULB1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
NRXN1Q9ULB1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
NRXN1Q9ULB1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
NRXN1Q9ULB1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NRXN1Q9ULB1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NRXN1Q9ULB1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NRXN1Q9ULB1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
NRXN1Q9ULB1 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
NRXN1Q9ULB1 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
NRXN1Q9ULB1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NRXN1Q9ULB1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NRXN1Q9ULB1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
NRXN1Q9ULB1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NRXN1Q9ULB1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
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