Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL4

GJD2, Gap junction delta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD2Q9UKL4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJD2Q9UKL4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GJD2Q9UKL4 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJD2Q9UKL4 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJD2Q9UKL4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJD2Q9UKL4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJD2Q9UKL4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJD2Q9UKL4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJD2Q9UKL4 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJD2Q9UKL4 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJD2Q9UKL4 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJD2Q9UKL4 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJD2Q9UKL4 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJD2Q9UKL4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJD2Q9UKL4 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJD2Q9UKL4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GJD2Q9UKL4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJD2Q9UKL4 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJD2Q9UKL4 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GJD2Q9UKL4 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJD2Q9UKL4 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJD2Q9UKL4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJD2Q9UKL4 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GJD2Q9UKL4 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJD2Q9UKL4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJD2Q9UKL4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJD2Q9UKL4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJD2Q9UKL4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJD2Q9UKL4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJD2Q9UKL4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GJD2Q9UKL4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJD2Q9UKL4 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJD2Q9UKL4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJD2Q9UKL4 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJD2Q9UKL4 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJD2Q9UKL4 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJD2Q9UKL4 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJD2Q9UKL4 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJD2Q9UKL4 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJD2Q9UKL4 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJD2Q9UKL4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GJD2Q9UKL4 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJD2Q9UKL4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJD2Q9UKL4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJD2Q9UKL4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJD2Q9UKL4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJD2Q9UKL4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJD2Q9UKL4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJD2Q9UKL4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJD2Q9UKL4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJD2Q9UKL4 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJD2Q9UKL4 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJD2Q9UKL4 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJD2Q9UKL4 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJD2Q9UKL4 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJD2Q9UKL4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJD2Q9UKL4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJD2Q9UKL4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJD2Q9UKL4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GJD2Q9UKL4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.47
GJD2Q9UKL4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJD2Q9UKL4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJD2Q9UKL4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJD2Q9UKL4 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJD2Q9UKL4 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJD2Q9UKL4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJD2Q9UKL4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJD2Q9UKL4 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJD2Q9UKL4 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJD2Q9UKL4 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GJD2Q9UKL4 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJD2Q9UKL4 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJD2Q9UKL4 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GJD2Q9UKL4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJD2Q9UKL4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJD2Q9UKL4 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJD2Q9UKL4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJD2Q9UKL4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJD2Q9UKL4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJD2Q9UKL4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJD2Q9UKL4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJD2Q9UKL4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJD2Q9UKL4 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJD2Q9UKL4 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJD2Q9UKL4 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJD2Q9UKL4 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GJD2Q9UKL4 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJD2Q9UKL4 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJD2Q9UKL4 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJD2Q9UKL4 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJD2Q9UKL4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GJD2Q9UKL4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJD2Q9UKL4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJD2Q9UKL4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJD2Q9UKL4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJD2Q9UKL4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJD2Q9UKL4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJD2Q9UKL4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJD2Q9UKL4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJD2Q9UKL4 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms