Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJK0

TSR3, Ribosome biogenesis protein TSR3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR3Q9UJK0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSR3Q9UJK0 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSR3Q9UJK0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSR3Q9UJK0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSR3Q9UJK0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSR3Q9UJK0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSR3Q9UJK0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSR3Q9UJK0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSR3Q9UJK0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSR3Q9UJK0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSR3Q9UJK0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSR3Q9UJK0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSR3Q9UJK0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSR3Q9UJK0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSR3Q9UJK0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSR3Q9UJK0 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSR3Q9UJK0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSR3Q9UJK0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSR3Q9UJK0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSR3Q9UJK0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSR3Q9UJK0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSR3Q9UJK0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSR3Q9UJK0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSR3Q9UJK0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSR3Q9UJK0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSR3Q9UJK0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSR3Q9UJK0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSR3Q9UJK0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSR3Q9UJK0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSR3Q9UJK0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSR3Q9UJK0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TSR3Q9UJK0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSR3Q9UJK0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSR3Q9UJK0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSR3Q9UJK0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TSR3Q9UJK0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSR3Q9UJK0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TSR3Q9UJK0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TSR3Q9UJK0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TSR3Q9UJK0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSR3Q9UJK0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSR3Q9UJK0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSR3Q9UJK0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSR3Q9UJK0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSR3Q9UJK0 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSR3Q9UJK0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSR3Q9UJK0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSR3Q9UJK0 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSR3Q9UJK0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSR3Q9UJK0 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSR3Q9UJK0 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSR3Q9UJK0 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSR3Q9UJK0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSR3Q9UJK0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSR3Q9UJK0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSR3Q9UJK0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSR3Q9UJK0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSR3Q9UJK0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSR3Q9UJK0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSR3Q9UJK0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSR3Q9UJK0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSR3Q9UJK0 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSR3Q9UJK0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSR3Q9UJK0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSR3Q9UJK0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSR3Q9UJK0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSR3Q9UJK0 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSR3Q9UJK0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSR3Q9UJK0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TSR3Q9UJK0 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSR3Q9UJK0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSR3Q9UJK0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSR3Q9UJK0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSR3Q9UJK0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSR3Q9UJK0 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSR3Q9UJK0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSR3Q9UJK0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSR3Q9UJK0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSR3Q9UJK0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSR3Q9UJK0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSR3Q9UJK0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSR3Q9UJK0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSR3Q9UJK0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSR3Q9UJK0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSR3Q9UJK0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TSR3Q9UJK0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSR3Q9UJK0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSR3Q9UJK0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSR3Q9UJK0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSR3Q9UJK0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSR3Q9UJK0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSR3Q9UJK0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSR3Q9UJK0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSR3Q9UJK0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSR3Q9UJK0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TSR3Q9UJK0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSR3Q9UJK0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TSR3Q9UJK0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TSR3Q9UJK0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TSR3Q9UJK0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms