Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW2

PLXNA1, Plexin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 1,896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA1Q9UIW2 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLXNA1Q9UIW2 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PLXNA1Q9UIW2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLXNA1Q9UIW2 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLXNA1Q9UIW2 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PLXNA1Q9UIW2 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLXNA1Q9UIW2 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLXNA1Q9UIW2 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLXNA1Q9UIW2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLXNA1Q9UIW2 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLXNA1Q9UIW2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLXNA1Q9UIW2 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLXNA1Q9UIW2 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLXNA1Q9UIW2 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLXNA1Q9UIW2 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PLXNA1Q9UIW2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLXNA1Q9UIW2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLXNA1Q9UIW2 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLXNA1Q9UIW2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLXNA1Q9UIW2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLXNA1Q9UIW2 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLXNA1Q9UIW2 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PLXNA1Q9UIW2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLXNA1Q9UIW2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLXNA1Q9UIW2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLXNA1Q9UIW2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLXNA1Q9UIW2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLXNA1Q9UIW2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLXNA1Q9UIW2 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLXNA1Q9UIW2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLXNA1Q9UIW2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLXNA1Q9UIW2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLXNA1Q9UIW2 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLXNA1Q9UIW2 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLXNA1Q9UIW2 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PLXNA1Q9UIW2 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLXNA1Q9UIW2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLXNA1Q9UIW2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLXNA1Q9UIW2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLXNA1Q9UIW2 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PLXNA1Q9UIW2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLXNA1Q9UIW2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLXNA1Q9UIW2 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLXNA1Q9UIW2 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLXNA1Q9UIW2 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLXNA1Q9UIW2 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLXNA1Q9UIW2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PLXNA1Q9UIW2 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLXNA1Q9UIW2 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLXNA1Q9UIW2 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLXNA1Q9UIW2 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLXNA1Q9UIW2 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PLXNA1Q9UIW2 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLXNA1Q9UIW2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PLXNA1Q9UIW2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PLXNA1Q9UIW2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PLXNA1Q9UIW2 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PLXNA1Q9UIW2 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PLXNA1Q9UIW2 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PLXNA1Q9UIW2 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PLXNA1Q9UIW2 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PLXNA1Q9UIW2 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PLXNA1Q9UIW2 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PLXNA1Q9UIW2 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PLXNA1Q9UIW2 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PLXNA1Q9UIW2 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PLXNA1Q9UIW2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PLXNA1Q9UIW2 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PLXNA1Q9UIW2 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PLXNA1Q9UIW2 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PLXNA1Q9UIW2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PLXNA1Q9UIW2 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PLXNA1Q9UIW2 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PLXNA1Q9UIW2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLXNA1Q9UIW2 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PLXNA1Q9UIW2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLXNA1Q9UIW2 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLXNA1Q9UIW2 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLXNA1Q9UIW2 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLXNA1Q9UIW2 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLXNA1Q9UIW2 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLXNA1Q9UIW2 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PLXNA1Q9UIW2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLXNA1Q9UIW2 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLXNA1Q9UIW2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLXNA1Q9UIW2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLXNA1Q9UIW2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLXNA1Q9UIW2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLXNA1Q9UIW2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLXNA1Q9UIW2 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLXNA1Q9UIW2 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PLXNA1Q9UIW2 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLXNA1Q9UIW2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLXNA1Q9UIW2 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLXNA1Q9UIW2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLXNA1Q9UIW2 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLXNA1Q9UIW2 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PLXNA1Q9UIW2 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLXNA1Q9UIW2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLXNA1Q9UIW2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms