Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTNAP2Q9UHC6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNTNAP2Q9UHC6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNTNAP2Q9UHC6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNTNAP2Q9UHC6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNTNAP2Q9UHC6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNTNAP2Q9UHC6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNTNAP2Q9UHC6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNTNAP2Q9UHC6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNTNAP2Q9UHC6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNTNAP2Q9UHC6 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNTNAP2Q9UHC6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNTNAP2Q9UHC6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNTNAP2Q9UHC6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNTNAP2Q9UHC6 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNTNAP2Q9UHC6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNTNAP2Q9UHC6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNTNAP2Q9UHC6 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNTNAP2Q9UHC6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTNAP2Q9UHC6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTNAP2Q9UHC6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTNAP2Q9UHC6 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTNAP2Q9UHC6 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTNAP2Q9UHC6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTNAP2Q9UHC6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTNAP2Q9UHC6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTNAP2Q9UHC6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTNAP2Q9UHC6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTNAP2Q9UHC6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTNAP2Q9UHC6 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTNAP2Q9UHC6 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTNAP2Q9UHC6 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTNAP2Q9UHC6 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTNAP2Q9UHC6 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTNAP2Q9UHC6 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTNAP2Q9UHC6 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTNAP2Q9UHC6 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTNAP2Q9UHC6 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTNAP2Q9UHC6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTNAP2Q9UHC6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTNAP2Q9UHC6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTNAP2Q9UHC6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTNAP2Q9UHC6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTNAP2Q9UHC6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTNAP2Q9UHC6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTNAP2Q9UHC6 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTNAP2Q9UHC6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTNAP2Q9UHC6 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTNAP2Q9UHC6 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTNAP2Q9UHC6 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTNAP2Q9UHC6 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTNAP2Q9UHC6 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTNAP2Q9UHC6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTNAP2Q9UHC6 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTNAP2Q9UHC6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTNAP2Q9UHC6 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTNAP2Q9UHC6 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTNAP2Q9UHC6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTNAP2Q9UHC6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTNAP2Q9UHC6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTNAP2Q9UHC6 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTNAP2Q9UHC6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTNAP2Q9UHC6 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTNAP2Q9UHC6 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTNAP2Q9UHC6 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTNAP2Q9UHC6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTNAP2Q9UHC6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTNAP2Q9UHC6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTNAP2Q9UHC6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTNAP2Q9UHC6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTNAP2Q9UHC6 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTNAP2Q9UHC6 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTNAP2Q9UHC6 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTNAP2Q9UHC6 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTNAP2Q9UHC6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTNAP2Q9UHC6 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTNAP2Q9UHC6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTNAP2Q9UHC6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTNAP2Q9UHC6 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTNAP2Q9UHC6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTNAP2Q9UHC6 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTNAP2Q9UHC6 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTNAP2Q9UHC6 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTNAP2Q9UHC6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTNAP2Q9UHC6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTNAP2Q9UHC6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTNAP2Q9UHC6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTNAP2Q9UHC6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTNAP2Q9UHC6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTNAP2Q9UHC6 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CNTNAP2Q9UHC6 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
CNTNAP2Q9UHC6 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CNTNAP2Q9UHC6 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms