Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU5

HMGXB4, HMG domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB4Q9UGU5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMGXB4Q9UGU5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
HMGXB4Q9UGU5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
HMGXB4Q9UGU5 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMGXB4Q9UGU5 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMGXB4Q9UGU5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMGXB4Q9UGU5 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HMGXB4Q9UGU5 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMGXB4Q9UGU5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMGXB4Q9UGU5 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMGXB4Q9UGU5 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMGXB4Q9UGU5 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMGXB4Q9UGU5 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMGXB4Q9UGU5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMGXB4Q9UGU5 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HMGXB4Q9UGU5 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMGXB4Q9UGU5 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMGXB4Q9UGU5 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMGXB4Q9UGU5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMGXB4Q9UGU5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMGXB4Q9UGU5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMGXB4Q9UGU5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGXB4Q9UGU5 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGXB4Q9UGU5 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGXB4Q9UGU5 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGXB4Q9UGU5 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGXB4Q9UGU5 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGXB4Q9UGU5 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGXB4Q9UGU5 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGXB4Q9UGU5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGXB4Q9UGU5 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGXB4Q9UGU5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGXB4Q9UGU5 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGXB4Q9UGU5 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGXB4Q9UGU5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGXB4Q9UGU5 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGXB4Q9UGU5 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGXB4Q9UGU5 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGXB4Q9UGU5 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGXB4Q9UGU5 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGXB4Q9UGU5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGXB4Q9UGU5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGXB4Q9UGU5 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGXB4Q9UGU5 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGXB4Q9UGU5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGXB4Q9UGU5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGXB4Q9UGU5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGXB4Q9UGU5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGXB4Q9UGU5 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGXB4Q9UGU5 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGXB4Q9UGU5 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGXB4Q9UGU5 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGXB4Q9UGU5 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGXB4Q9UGU5 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGXB4Q9UGU5 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGXB4Q9UGU5 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGXB4Q9UGU5 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGXB4Q9UGU5 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGXB4Q9UGU5 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGXB4Q9UGU5 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGXB4Q9UGU5 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGXB4Q9UGU5 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGXB4Q9UGU5 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGXB4Q9UGU5 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGXB4Q9UGU5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGXB4Q9UGU5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGXB4Q9UGU5 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGXB4Q9UGU5 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGXB4Q9UGU5 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGXB4Q9UGU5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGXB4Q9UGU5 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGXB4Q9UGU5 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGXB4Q9UGU5 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGXB4Q9UGU5 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGXB4Q9UGU5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGXB4Q9UGU5 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGXB4Q9UGU5 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGXB4Q9UGU5 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGXB4Q9UGU5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGXB4Q9UGU5 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGXB4Q9UGU5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGXB4Q9UGU5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGXB4Q9UGU5 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGXB4Q9UGU5 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGXB4Q9UGU5 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGXB4Q9UGU5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGXB4Q9UGU5 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGXB4Q9UGU5 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGXB4Q9UGU5 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGXB4Q9UGU5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HMGXB4Q9UGU5 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGXB4Q9UGU5 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGXB4Q9UGU5 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGXB4Q9UGU5 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGXB4Q9UGU5 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGXB4Q9UGU5 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGXB4Q9UGU5 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGXB4Q9UGU5 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGXB4Q9UGU5 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGXB4Q9UGU5 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms