Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLIP2Q9UDT6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CLIP2Q9UDT6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLIP2Q9UDT6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLIP2Q9UDT6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLIP2Q9UDT6 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLIP2Q9UDT6 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLIP2Q9UDT6 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLIP2Q9UDT6 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLIP2Q9UDT6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLIP2Q9UDT6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLIP2Q9UDT6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLIP2Q9UDT6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CLIP2Q9UDT6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLIP2Q9UDT6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLIP2Q9UDT6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLIP2Q9UDT6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLIP2Q9UDT6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLIP2Q9UDT6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLIP2Q9UDT6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLIP2Q9UDT6 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLIP2Q9UDT6 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLIP2Q9UDT6 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLIP2Q9UDT6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLIP2Q9UDT6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLIP2Q9UDT6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLIP2Q9UDT6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLIP2Q9UDT6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLIP2Q9UDT6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CLIP2Q9UDT6 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLIP2Q9UDT6 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLIP2Q9UDT6 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLIP2Q9UDT6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLIP2Q9UDT6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLIP2Q9UDT6 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLIP2Q9UDT6 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLIP2Q9UDT6 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLIP2Q9UDT6 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLIP2Q9UDT6 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLIP2Q9UDT6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLIP2Q9UDT6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLIP2Q9UDT6 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLIP2Q9UDT6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLIP2Q9UDT6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLIP2Q9UDT6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLIP2Q9UDT6 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLIP2Q9UDT6 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLIP2Q9UDT6 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CLIP2Q9UDT6 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CLIP2Q9UDT6 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLIP2Q9UDT6 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CLIP2Q9UDT6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLIP2Q9UDT6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLIP2Q9UDT6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CLIP2Q9UDT6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLIP2Q9UDT6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLIP2Q9UDT6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLIP2Q9UDT6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLIP2Q9UDT6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLIP2Q9UDT6 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLIP2Q9UDT6 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLIP2Q9UDT6 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLIP2Q9UDT6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLIP2Q9UDT6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLIP2Q9UDT6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLIP2Q9UDT6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLIP2Q9UDT6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CLIP2Q9UDT6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
CLIP2Q9UDT6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLIP2Q9UDT6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLIP2Q9UDT6 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLIP2Q9UDT6 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLIP2Q9UDT6 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CLIP2Q9UDT6 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLIP2Q9UDT6 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLIP2Q9UDT6 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLIP2Q9UDT6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLIP2Q9UDT6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLIP2Q9UDT6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLIP2Q9UDT6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLIP2Q9UDT6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLIP2Q9UDT6 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLIP2Q9UDT6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLIP2Q9UDT6 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CLIP2Q9UDT6 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLIP2Q9UDT6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLIP2Q9UDT6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLIP2Q9UDT6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLIP2Q9UDT6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLIP2Q9UDT6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLIP2Q9UDT6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLIP2Q9UDT6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLIP2Q9UDT6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLIP2Q9UDT6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLIP2Q9UDT6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLIP2Q9UDT6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLIP2Q9UDT6 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CLIP2Q9UDT6 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLIP2Q9UDT6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLIP2Q9UDT6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms