Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
COPS7AQ9UBW8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
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