Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU9

NXF1, Nuclear RNA export factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF1Q9UBU9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NXF1Q9UBU9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NXF1Q9UBU9 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NXF1Q9UBU9 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NXF1Q9UBU9 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NXF1Q9UBU9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NXF1Q9UBU9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NXF1Q9UBU9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NXF1Q9UBU9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NXF1Q9UBU9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NXF1Q9UBU9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NXF1Q9UBU9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NXF1Q9UBU9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NXF1Q9UBU9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NXF1Q9UBU9 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NXF1Q9UBU9 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NXF1Q9UBU9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NXF1Q9UBU9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NXF1Q9UBU9 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NXF1Q9UBU9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NXF1Q9UBU9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NXF1Q9UBU9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NXF1Q9UBU9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NXF1Q9UBU9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NXF1Q9UBU9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NXF1Q9UBU9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NXF1Q9UBU9 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NXF1Q9UBU9 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NXF1Q9UBU9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NXF1Q9UBU9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NXF1Q9UBU9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NXF1Q9UBU9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NXF1Q9UBU9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NXF1Q9UBU9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NXF1Q9UBU9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NXF1Q9UBU9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NXF1Q9UBU9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NXF1Q9UBU9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NXF1Q9UBU9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NXF1Q9UBU9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NXF1Q9UBU9 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NXF1Q9UBU9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NXF1Q9UBU9 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NXF1Q9UBU9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NXF1Q9UBU9 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NXF1Q9UBU9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NXF1Q9UBU9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NXF1Q9UBU9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NXF1Q9UBU9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NXF1Q9UBU9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NXF1Q9UBU9 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NXF1Q9UBU9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NXF1Q9UBU9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NXF1Q9UBU9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NXF1Q9UBU9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NXF1Q9UBU9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NXF1Q9UBU9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NXF1Q9UBU9 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NXF1Q9UBU9 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NXF1Q9UBU9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NXF1Q9UBU9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NXF1Q9UBU9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NXF1Q9UBU9 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NXF1Q9UBU9 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NXF1Q9UBU9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NXF1Q9UBU9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NXF1Q9UBU9 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NXF1Q9UBU9 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NXF1Q9UBU9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NXF1Q9UBU9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NXF1Q9UBU9 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NXF1Q9UBU9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NXF1Q9UBU9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NXF1Q9UBU9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NXF1Q9UBU9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NXF1Q9UBU9 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NXF1Q9UBU9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NXF1Q9UBU9 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms