Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DKK2Q9UBU2 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms