Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms