Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2D1

CHD7, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 2,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD7Q9P2D1 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHD7Q9P2D1 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHD7Q9P2D1 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHD7Q9P2D1 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHD7Q9P2D1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHD7Q9P2D1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHD7Q9P2D1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHD7Q9P2D1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHD7Q9P2D1 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHD7Q9P2D1 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHD7Q9P2D1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHD7Q9P2D1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHD7Q9P2D1 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHD7Q9P2D1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHD7Q9P2D1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHD7Q9P2D1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHD7Q9P2D1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHD7Q9P2D1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHD7Q9P2D1 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHD7Q9P2D1 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHD7Q9P2D1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHD7Q9P2D1 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHD7Q9P2D1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHD7Q9P2D1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHD7Q9P2D1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHD7Q9P2D1 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHD7Q9P2D1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHD7Q9P2D1 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHD7Q9P2D1 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHD7Q9P2D1 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHD7Q9P2D1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHD7Q9P2D1 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHD7Q9P2D1 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CHD7Q9P2D1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHD7Q9P2D1 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CHD7Q9P2D1 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHD7Q9P2D1 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CHD7Q9P2D1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHD7Q9P2D1 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHD7Q9P2D1 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHD7Q9P2D1 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHD7Q9P2D1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHD7Q9P2D1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHD7Q9P2D1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHD7Q9P2D1 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHD7Q9P2D1 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHD7Q9P2D1 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHD7Q9P2D1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHD7Q9P2D1 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHD7Q9P2D1 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHD7Q9P2D1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHD7Q9P2D1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHD7Q9P2D1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHD7Q9P2D1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHD7Q9P2D1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHD7Q9P2D1 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHD7Q9P2D1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHD7Q9P2D1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHD7Q9P2D1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHD7Q9P2D1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHD7Q9P2D1 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHD7Q9P2D1 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHD7Q9P2D1 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHD7Q9P2D1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CHD7Q9P2D1 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CHD7Q9P2D1 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHD7Q9P2D1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHD7Q9P2D1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHD7Q9P2D1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHD7Q9P2D1 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHD7Q9P2D1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHD7Q9P2D1 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHD7Q9P2D1 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHD7Q9P2D1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHD7Q9P2D1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CHD7Q9P2D1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHD7Q9P2D1 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHD7Q9P2D1 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHD7Q9P2D1 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHD7Q9P2D1 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHD7Q9P2D1 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHD7Q9P2D1 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CHD7Q9P2D1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHD7Q9P2D1 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHD7Q9P2D1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHD7Q9P2D1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHD7Q9P2D1 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHD7Q9P2D1 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHD7Q9P2D1 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHD7Q9P2D1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHD7Q9P2D1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHD7Q9P2D1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CHD7Q9P2D1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHD7Q9P2D1 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHD7Q9P2D1 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHD7Q9P2D1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHD7Q9P2D1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHD7Q9P2D1 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHD7Q9P2D1 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHD7Q9P2D1 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms