Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W0

IFNK, Interferon kappa, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNKQ9P0W0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFNKQ9P0W0 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFNKQ9P0W0 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFNKQ9P0W0 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFNKQ9P0W0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFNKQ9P0W0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFNKQ9P0W0 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFNKQ9P0W0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFNKQ9P0W0 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFNKQ9P0W0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFNKQ9P0W0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFNKQ9P0W0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
IFNKQ9P0W0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFNKQ9P0W0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFNKQ9P0W0 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFNKQ9P0W0 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFNKQ9P0W0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFNKQ9P0W0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IFNKQ9P0W0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IFNKQ9P0W0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IFNKQ9P0W0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IFNKQ9P0W0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IFNKQ9P0W0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IFNKQ9P0W0 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IFNKQ9P0W0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFNKQ9P0W0 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFNKQ9P0W0 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFNKQ9P0W0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFNKQ9P0W0 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFNKQ9P0W0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFNKQ9P0W0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFNKQ9P0W0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFNKQ9P0W0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
IFNKQ9P0W0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
IFNKQ9P0W0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
IFNKQ9P0W0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
IFNKQ9P0W0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
IFNKQ9P0W0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
IFNKQ9P0W0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
IFNKQ9P0W0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFNKQ9P0W0 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFNKQ9P0W0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFNKQ9P0W0 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFNKQ9P0W0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFNKQ9P0W0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IFNKQ9P0W0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IFNKQ9P0W0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
IFNKQ9P0W0 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IFNKQ9P0W0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IFNKQ9P0W0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IFNKQ9P0W0 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IFNKQ9P0W0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFNKQ9P0W0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFNKQ9P0W0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFNKQ9P0W0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFNKQ9P0W0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFNKQ9P0W0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFNKQ9P0W0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFNKQ9P0W0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFNKQ9P0W0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFNKQ9P0W0 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
IFNKQ9P0W0 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFNKQ9P0W0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFNKQ9P0W0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
IFNKQ9P0W0 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFNKQ9P0W0 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFNKQ9P0W0 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
IFNKQ9P0W0 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFNKQ9P0W0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFNKQ9P0W0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFNKQ9P0W0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFNKQ9P0W0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFNKQ9P0W0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFNKQ9P0W0 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFNKQ9P0W0 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
IFNKQ9P0W0 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFNKQ9P0W0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFNKQ9P0W0 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFNKQ9P0W0 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFNKQ9P0W0 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFNKQ9P0W0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFNKQ9P0W0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFNKQ9P0W0 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFNKQ9P0W0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFNKQ9P0W0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFNKQ9P0W0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFNKQ9P0W0 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFNKQ9P0W0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFNKQ9P0W0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFNKQ9P0W0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFNKQ9P0W0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFNKQ9P0W0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFNKQ9P0W0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFNKQ9P0W0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFNKQ9P0W0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFNKQ9P0W0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFNKQ9P0W0 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFNKQ9P0W0 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFNKQ9P0W0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFNKQ9P0W0 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms