Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EHD3Q9NZN3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
EHD3Q9NZN3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
EHD3Q9NZN3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
EHD3Q9NZN3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
EHD3Q9NZN3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
EHD3Q9NZN3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EHD3Q9NZN3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EHD3Q9NZN3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EHD3Q9NZN3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EHD3Q9NZN3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
EHD3Q9NZN3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EHD3Q9NZN3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms