Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDE1Q9NZC3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDE1Q9NZC3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDE1Q9NZC3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GDE1Q9NZC3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GDE1Q9NZC3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GDE1Q9NZC3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GDE1Q9NZC3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GDE1Q9NZC3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GDE1Q9NZC3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GDE1Q9NZC3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GDE1Q9NZC3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GDE1Q9NZC3 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GDE1Q9NZC3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GDE1Q9NZC3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GDE1Q9NZC3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GDE1Q9NZC3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GDE1Q9NZC3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GDE1Q9NZC3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GDE1Q9NZC3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GDE1Q9NZC3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDE1Q9NZC3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDE1Q9NZC3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDE1Q9NZC3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDE1Q9NZC3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDE1Q9NZC3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDE1Q9NZC3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GDE1Q9NZC3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDE1Q9NZC3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDE1Q9NZC3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDE1Q9NZC3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDE1Q9NZC3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDE1Q9NZC3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDE1Q9NZC3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDE1Q9NZC3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDE1Q9NZC3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDE1Q9NZC3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDE1Q9NZC3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDE1Q9NZC3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDE1Q9NZC3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDE1Q9NZC3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDE1Q9NZC3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDE1Q9NZC3 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDE1Q9NZC3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDE1Q9NZC3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDE1Q9NZC3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDE1Q9NZC3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDE1Q9NZC3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDE1Q9NZC3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDE1Q9NZC3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDE1Q9NZC3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDE1Q9NZC3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDE1Q9NZC3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDE1Q9NZC3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDE1Q9NZC3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDE1Q9NZC3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDE1Q9NZC3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GDE1Q9NZC3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDE1Q9NZC3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDE1Q9NZC3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDE1Q9NZC3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDE1Q9NZC3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDE1Q9NZC3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDE1Q9NZC3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GDE1Q9NZC3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDE1Q9NZC3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDE1Q9NZC3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDE1Q9NZC3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GDE1Q9NZC3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GDE1Q9NZC3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GDE1Q9NZC3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GDE1Q9NZC3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDE1Q9NZC3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GDE1Q9NZC3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDE1Q9NZC3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDE1Q9NZC3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDE1Q9NZC3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDE1Q9NZC3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDE1Q9NZC3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDE1Q9NZC3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDE1Q9NZC3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDE1Q9NZC3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDE1Q9NZC3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDE1Q9NZC3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDE1Q9NZC3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDE1Q9NZC3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDE1Q9NZC3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDE1Q9NZC3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDE1Q9NZC3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDE1Q9NZC3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDE1Q9NZC3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDE1Q9NZC3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDE1Q9NZC3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDE1Q9NZC3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDE1Q9NZC3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDE1Q9NZC3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDE1Q9NZC3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDE1Q9NZC3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GDE1Q9NZC3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GDE1Q9NZC3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
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