Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVM6

DNAJC17, DnaJ homolog subfamily C member 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC17Q9NVM6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNAJC17Q9NVM6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNAJC17Q9NVM6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNAJC17Q9NVM6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNAJC17Q9NVM6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNAJC17Q9NVM6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNAJC17Q9NVM6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNAJC17Q9NVM6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNAJC17Q9NVM6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNAJC17Q9NVM6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNAJC17Q9NVM6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNAJC17Q9NVM6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNAJC17Q9NVM6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNAJC17Q9NVM6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNAJC17Q9NVM6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNAJC17Q9NVM6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNAJC17Q9NVM6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNAJC17Q9NVM6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNAJC17Q9NVM6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNAJC17Q9NVM6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNAJC17Q9NVM6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
DNAJC17Q9NVM6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNAJC17Q9NVM6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNAJC17Q9NVM6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNAJC17Q9NVM6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
DNAJC17Q9NVM6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNAJC17Q9NVM6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNAJC17Q9NVM6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNAJC17Q9NVM6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNAJC17Q9NVM6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNAJC17Q9NVM6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNAJC17Q9NVM6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNAJC17Q9NVM6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNAJC17Q9NVM6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAJC17Q9NVM6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAJC17Q9NVM6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAJC17Q9NVM6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAJC17Q9NVM6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAJC17Q9NVM6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAJC17Q9NVM6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAJC17Q9NVM6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAJC17Q9NVM6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAJC17Q9NVM6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAJC17Q9NVM6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAJC17Q9NVM6 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAJC17Q9NVM6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAJC17Q9NVM6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAJC17Q9NVM6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAJC17Q9NVM6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAJC17Q9NVM6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAJC17Q9NVM6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAJC17Q9NVM6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAJC17Q9NVM6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAJC17Q9NVM6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAJC17Q9NVM6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAJC17Q9NVM6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAJC17Q9NVM6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAJC17Q9NVM6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNAJC17Q9NVM6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNAJC17Q9NVM6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNAJC17Q9NVM6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNAJC17Q9NVM6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNAJC17Q9NVM6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNAJC17Q9NVM6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
DNAJC17Q9NVM6 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
DNAJC17Q9NVM6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNAJC17Q9NVM6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNAJC17Q9NVM6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNAJC17Q9NVM6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
DNAJC17Q9NVM6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
DNAJC17Q9NVM6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
DNAJC17Q9NVM6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNAJC17Q9NVM6 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNAJC17Q9NVM6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNAJC17Q9NVM6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNAJC17Q9NVM6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNAJC17Q9NVM6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNAJC17Q9NVM6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNAJC17Q9NVM6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
DNAJC17Q9NVM6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
DNAJC17Q9NVM6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNAJC17Q9NVM6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNAJC17Q9NVM6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNAJC17Q9NVM6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNAJC17Q9NVM6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNAJC17Q9NVM6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNAJC17Q9NVM6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNAJC17Q9NVM6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNAJC17Q9NVM6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNAJC17Q9NVM6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNAJC17Q9NVM6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNAJC17Q9NVM6 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
DNAJC17Q9NVM6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNAJC17Q9NVM6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
DNAJC17Q9NVM6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNAJC17Q9NVM6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNAJC17Q9NVM6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNAJC17Q9NVM6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNAJC17Q9NVM6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNAJC17Q9NVM6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms