Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV88

INTS9, Integrator complex subunit 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS9Q9NV88 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
INTS9Q9NV88 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
INTS9Q9NV88 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
INTS9Q9NV88 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
INTS9Q9NV88 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
INTS9Q9NV88 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
INTS9Q9NV88 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
INTS9Q9NV88 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
INTS9Q9NV88 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
INTS9Q9NV88 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
INTS9Q9NV88 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
INTS9Q9NV88 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
INTS9Q9NV88 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
INTS9Q9NV88 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
INTS9Q9NV88 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
INTS9Q9NV88 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
INTS9Q9NV88 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
INTS9Q9NV88 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
INTS9Q9NV88 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
INTS9Q9NV88 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
INTS9Q9NV88 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
INTS9Q9NV88 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
INTS9Q9NV88 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
INTS9Q9NV88 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
INTS9Q9NV88 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
INTS9Q9NV88 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
INTS9Q9NV88 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
INTS9Q9NV88 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
INTS9Q9NV88 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
INTS9Q9NV88 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
INTS9Q9NV88 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
INTS9Q9NV88 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
INTS9Q9NV88 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
INTS9Q9NV88 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
INTS9Q9NV88 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
INTS9Q9NV88 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
INTS9Q9NV88 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
INTS9Q9NV88 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
INTS9Q9NV88 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
INTS9Q9NV88 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
INTS9Q9NV88 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
INTS9Q9NV88 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
INTS9Q9NV88 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
INTS9Q9NV88 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
INTS9Q9NV88 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
INTS9Q9NV88 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
INTS9Q9NV88 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
INTS9Q9NV88 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
INTS9Q9NV88 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
INTS9Q9NV88 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
INTS9Q9NV88 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
INTS9Q9NV88 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
INTS9Q9NV88 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
INTS9Q9NV88 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
INTS9Q9NV88 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
INTS9Q9NV88 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
INTS9Q9NV88 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
INTS9Q9NV88 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
INTS9Q9NV88 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
INTS9Q9NV88 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
INTS9Q9NV88 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
INTS9Q9NV88 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
INTS9Q9NV88 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
INTS9Q9NV88 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
INTS9Q9NV88 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
INTS9Q9NV88 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
INTS9Q9NV88 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
INTS9Q9NV88 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
INTS9Q9NV88 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
INTS9Q9NV88 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
INTS9Q9NV88 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
INTS9Q9NV88 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
INTS9Q9NV88 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
INTS9Q9NV88 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
INTS9Q9NV88 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
INTS9Q9NV88 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
INTS9Q9NV88 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
INTS9Q9NV88 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
INTS9Q9NV88 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
INTS9Q9NV88 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
INTS9Q9NV88 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
INTS9Q9NV88 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
INTS9Q9NV88 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
INTS9Q9NV88 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
INTS9Q9NV88 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
INTS9Q9NV88 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
INTS9Q9NV88 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
INTS9Q9NV88 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
INTS9Q9NV88 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
INTS9Q9NV88 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
INTS9Q9NV88 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
INTS9Q9NV88 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
INTS9Q9NV88 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
INTS9Q9NV88 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
INTS9Q9NV88 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
INTS9Q9NV88 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
INTS9Q9NV88 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
INTS9Q9NV88 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
INTS9Q9NV88 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
INTS9Q9NV88 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms