Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV12

TMEM140, Transmembrane protein 140, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM140Q9NV12 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM140Q9NV12 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM140Q9NV12 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms