Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC39A9Q9NUM3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC39A9Q9NUM3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms