Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GINM1Q9NU53 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GINM1Q9NU53 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GINM1Q9NU53 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GINM1Q9NU53 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GINM1Q9NU53 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GINM1Q9NU53 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GINM1Q9NU53 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GINM1Q9NU53 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GINM1Q9NU53 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GINM1Q9NU53 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GINM1Q9NU53 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GINM1Q9NU53 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GINM1Q9NU53 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GINM1Q9NU53 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GINM1Q9NU53 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GINM1Q9NU53 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GINM1Q9NU53 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GINM1Q9NU53 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GINM1Q9NU53 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GINM1Q9NU53 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GINM1Q9NU53 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GINM1Q9NU53 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GINM1Q9NU53 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GINM1Q9NU53 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GINM1Q9NU53 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GINM1Q9NU53 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GINM1Q9NU53 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GINM1Q9NU53 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GINM1Q9NU53 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GINM1Q9NU53 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GINM1Q9NU53 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GINM1Q9NU53 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GINM1Q9NU53 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GINM1Q9NU53 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GINM1Q9NU53 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GINM1Q9NU53 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GINM1Q9NU53 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GINM1Q9NU53 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GINM1Q9NU53 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GINM1Q9NU53 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GINM1Q9NU53 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GINM1Q9NU53 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GINM1Q9NU53 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
GINM1Q9NU53 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GINM1Q9NU53 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GINM1Q9NU53 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GINM1Q9NU53 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GINM1Q9NU53 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GINM1Q9NU53 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GINM1Q9NU53 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GINM1Q9NU53 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GINM1Q9NU53 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GINM1Q9NU53 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GINM1Q9NU53 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GINM1Q9NU53 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GINM1Q9NU53 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GINM1Q9NU53 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GINM1Q9NU53 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GINM1Q9NU53 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GINM1Q9NU53 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GINM1Q9NU53 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GINM1Q9NU53 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GINM1Q9NU53 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GINM1Q9NU53 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GINM1Q9NU53 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GINM1Q9NU53 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GINM1Q9NU53 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GINM1Q9NU53 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GINM1Q9NU53 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GINM1Q9NU53 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
GINM1Q9NU53 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
GINM1Q9NU53 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GINM1Q9NU53 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GINM1Q9NU53 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GINM1Q9NU53 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GINM1Q9NU53 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GINM1Q9NU53 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GINM1Q9NU53 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GINM1Q9NU53 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GINM1Q9NU53 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GINM1Q9NU53 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GINM1Q9NU53 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GINM1Q9NU53 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GINM1Q9NU53 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GINM1Q9NU53 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GINM1Q9NU53 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GINM1Q9NU53 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GINM1Q9NU53 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GINM1Q9NU53 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GINM1Q9NU53 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GINM1Q9NU53 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GINM1Q9NU53 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GINM1Q9NU53 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GINM1Q9NU53 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GINM1Q9NU53 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GINM1Q9NU53 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GINM1Q9NU53 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GINM1Q9NU53 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GINM1Q9NU53 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms