Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSU2

TREX1, Three-prime repair exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX1Q9NSU2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TREX1Q9NSU2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TREX1Q9NSU2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TREX1Q9NSU2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TREX1Q9NSU2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TREX1Q9NSU2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TREX1Q9NSU2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TREX1Q9NSU2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TREX1Q9NSU2 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TREX1Q9NSU2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TREX1Q9NSU2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TREX1Q9NSU2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TREX1Q9NSU2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TREX1Q9NSU2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TREX1Q9NSU2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TREX1Q9NSU2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TREX1Q9NSU2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TREX1Q9NSU2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TREX1Q9NSU2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TREX1Q9NSU2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TREX1Q9NSU2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TREX1Q9NSU2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TREX1Q9NSU2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TREX1Q9NSU2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TREX1Q9NSU2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TREX1Q9NSU2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TREX1Q9NSU2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TREX1Q9NSU2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TREX1Q9NSU2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TREX1Q9NSU2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TREX1Q9NSU2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TREX1Q9NSU2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TREX1Q9NSU2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TREX1Q9NSU2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TREX1Q9NSU2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TREX1Q9NSU2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TREX1Q9NSU2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TREX1Q9NSU2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TREX1Q9NSU2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TREX1Q9NSU2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TREX1Q9NSU2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TREX1Q9NSU2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
TREX1Q9NSU2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TREX1Q9NSU2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TREX1Q9NSU2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TREX1Q9NSU2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TREX1Q9NSU2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TREX1Q9NSU2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TREX1Q9NSU2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TREX1Q9NSU2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TREX1Q9NSU2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TREX1Q9NSU2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.31■■□□□ 1
TREX1Q9NSU2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TREX1Q9NSU2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TREX1Q9NSU2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TREX1Q9NSU2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TREX1Q9NSU2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TREX1Q9NSU2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TREX1Q9NSU2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TREX1Q9NSU2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TREX1Q9NSU2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TREX1Q9NSU2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TREX1Q9NSU2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TREX1Q9NSU2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TREX1Q9NSU2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TREX1Q9NSU2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TREX1Q9NSU2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TREX1Q9NSU2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TREX1Q9NSU2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TREX1Q9NSU2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TREX1Q9NSU2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
TREX1Q9NSU2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TREX1Q9NSU2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TREX1Q9NSU2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TREX1Q9NSU2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TREX1Q9NSU2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TREX1Q9NSU2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TREX1Q9NSU2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TREX1Q9NSU2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TREX1Q9NSU2 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TREX1Q9NSU2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.29■■□□□ 1
TREX1Q9NSU2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TREX1Q9NSU2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TREX1Q9NSU2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TREX1Q9NSU2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TREX1Q9NSU2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TREX1Q9NSU2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TREX1Q9NSU2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TREX1Q9NSU2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TREX1Q9NSU2 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TREX1Q9NSU2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TREX1Q9NSU2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TREX1Q9NSU2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TREX1Q9NSU2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TREX1Q9NSU2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TREX1Q9NSU2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TREX1Q9NSU2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TREX1Q9NSU2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
TREX1Q9NSU2 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
TREX1Q9NSU2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms