Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CENPMQ9NSP4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CENPMQ9NSP4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CENPMQ9NSP4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CENPMQ9NSP4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CENPMQ9NSP4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CENPMQ9NSP4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CENPMQ9NSP4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CENPMQ9NSP4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CENPMQ9NSP4 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CENPMQ9NSP4 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CENPMQ9NSP4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CENPMQ9NSP4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CENPMQ9NSP4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CENPMQ9NSP4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CENPMQ9NSP4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CENPMQ9NSP4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CENPMQ9NSP4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CENPMQ9NSP4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CENPMQ9NSP4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CENPMQ9NSP4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPMQ9NSP4 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPMQ9NSP4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPMQ9NSP4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPMQ9NSP4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPMQ9NSP4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPMQ9NSP4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPMQ9NSP4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPMQ9NSP4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPMQ9NSP4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPMQ9NSP4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPMQ9NSP4 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPMQ9NSP4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPMQ9NSP4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPMQ9NSP4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPMQ9NSP4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPMQ9NSP4 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPMQ9NSP4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPMQ9NSP4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPMQ9NSP4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPMQ9NSP4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPMQ9NSP4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPMQ9NSP4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPMQ9NSP4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CENPMQ9NSP4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CENPMQ9NSP4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CENPMQ9NSP4 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CENPMQ9NSP4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CENPMQ9NSP4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CENPMQ9NSP4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CENPMQ9NSP4 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CENPMQ9NSP4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CENPMQ9NSP4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CENPMQ9NSP4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CENPMQ9NSP4 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CENPMQ9NSP4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CENPMQ9NSP4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CENPMQ9NSP4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CENPMQ9NSP4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CENPMQ9NSP4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CENPMQ9NSP4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CENPMQ9NSP4 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CENPMQ9NSP4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CENPMQ9NSP4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CENPMQ9NSP4 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CENPMQ9NSP4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CENPMQ9NSP4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CENPMQ9NSP4 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CENPMQ9NSP4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CENPMQ9NSP4 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CENPMQ9NSP4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CENPMQ9NSP4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CENPMQ9NSP4 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms