Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS68

TNFRSF19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF19Q9NS68 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TNFRSF19Q9NS68 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TNFRSF19Q9NS68 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFRSF19Q9NS68 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFRSF19Q9NS68 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFRSF19Q9NS68 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFRSF19Q9NS68 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFRSF19Q9NS68 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFRSF19Q9NS68 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFRSF19Q9NS68 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFRSF19Q9NS68 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFRSF19Q9NS68 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFRSF19Q9NS68 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFRSF19Q9NS68 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFRSF19Q9NS68 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFRSF19Q9NS68 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFRSF19Q9NS68 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFRSF19Q9NS68 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFRSF19Q9NS68 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFRSF19Q9NS68 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFRSF19Q9NS68 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFRSF19Q9NS68 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFRSF19Q9NS68 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TNFRSF19Q9NS68 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TNFRSF19Q9NS68 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TNFRSF19Q9NS68 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TNFRSF19Q9NS68 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TNFRSF19Q9NS68 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TNFRSF19Q9NS68 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TNFRSF19Q9NS68 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TNFRSF19Q9NS68 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TNFRSF19Q9NS68 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TNFRSF19Q9NS68 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TNFRSF19Q9NS68 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TNFRSF19Q9NS68 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms