Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS61

KCNIP2, Kv channel-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP2Q9NS61 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
KCNIP2Q9NS61 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNIP2Q9NS61 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms