Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMPRSS4Q9NRS4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMPRSS4Q9NRS4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMPRSS4Q9NRS4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TMPRSS4Q9NRS4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMPRSS4Q9NRS4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMPRSS4Q9NRS4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPRSS4Q9NRS4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPRSS4Q9NRS4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPRSS4Q9NRS4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPRSS4Q9NRS4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPRSS4Q9NRS4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPRSS4Q9NRS4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPRSS4Q9NRS4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPRSS4Q9NRS4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPRSS4Q9NRS4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPRSS4Q9NRS4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPRSS4Q9NRS4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPRSS4Q9NRS4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPRSS4Q9NRS4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPRSS4Q9NRS4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPRSS4Q9NRS4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPRSS4Q9NRS4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPRSS4Q9NRS4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPRSS4Q9NRS4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPRSS4Q9NRS4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPRSS4Q9NRS4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPRSS4Q9NRS4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPRSS4Q9NRS4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPRSS4Q9NRS4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPRSS4Q9NRS4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPRSS4Q9NRS4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPRSS4Q9NRS4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPRSS4Q9NRS4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPRSS4Q9NRS4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPRSS4Q9NRS4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPRSS4Q9NRS4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPRSS4Q9NRS4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPRSS4Q9NRS4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPRSS4Q9NRS4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPRSS4Q9NRS4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPRSS4Q9NRS4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPRSS4Q9NRS4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPRSS4Q9NRS4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPRSS4Q9NRS4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPRSS4Q9NRS4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPRSS4Q9NRS4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPRSS4Q9NRS4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPRSS4Q9NRS4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPRSS4Q9NRS4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPRSS4Q9NRS4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPRSS4Q9NRS4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPRSS4Q9NRS4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPRSS4Q9NRS4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPRSS4Q9NRS4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPRSS4Q9NRS4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPRSS4Q9NRS4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPRSS4Q9NRS4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPRSS4Q9NRS4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPRSS4Q9NRS4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPRSS4Q9NRS4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPRSS4Q9NRS4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPRSS4Q9NRS4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMPRSS4Q9NRS4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMPRSS4Q9NRS4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
TMPRSS4Q9NRS4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMPRSS4Q9NRS4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMPRSS4Q9NRS4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMPRSS4Q9NRS4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMPRSS4Q9NRS4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMPRSS4Q9NRS4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms