Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRG0

CHRAC1, Chromatin accessibility complex protein 1, humanhuman

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Length 131 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRAC1Q9NRG0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRAC1Q9NRG0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRAC1Q9NRG0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRAC1Q9NRG0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRAC1Q9NRG0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRAC1Q9NRG0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRAC1Q9NRG0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRAC1Q9NRG0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRAC1Q9NRG0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRAC1Q9NRG0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRAC1Q9NRG0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRAC1Q9NRG0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRAC1Q9NRG0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRAC1Q9NRG0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRAC1Q9NRG0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRAC1Q9NRG0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRAC1Q9NRG0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRAC1Q9NRG0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRAC1Q9NRG0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRAC1Q9NRG0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRAC1Q9NRG0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRAC1Q9NRG0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRAC1Q9NRG0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRAC1Q9NRG0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRAC1Q9NRG0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRAC1Q9NRG0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRAC1Q9NRG0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRAC1Q9NRG0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRAC1Q9NRG0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRAC1Q9NRG0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRAC1Q9NRG0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRAC1Q9NRG0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRAC1Q9NRG0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRAC1Q9NRG0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRAC1Q9NRG0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRAC1Q9NRG0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRAC1Q9NRG0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRAC1Q9NRG0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRAC1Q9NRG0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRAC1Q9NRG0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRAC1Q9NRG0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRAC1Q9NRG0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRAC1Q9NRG0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRAC1Q9NRG0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRAC1Q9NRG0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRAC1Q9NRG0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRAC1Q9NRG0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRAC1Q9NRG0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRAC1Q9NRG0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRAC1Q9NRG0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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