Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV6

PRDM10, PR domain zinc finger protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM10Q9NQV6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRDM10Q9NQV6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRDM10Q9NQV6 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRDM10Q9NQV6 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRDM10Q9NQV6 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRDM10Q9NQV6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PRDM10Q9NQV6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRDM10Q9NQV6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRDM10Q9NQV6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRDM10Q9NQV6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRDM10Q9NQV6 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRDM10Q9NQV6 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRDM10Q9NQV6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRDM10Q9NQV6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRDM10Q9NQV6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRDM10Q9NQV6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRDM10Q9NQV6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRDM10Q9NQV6 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRDM10Q9NQV6 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PRDM10Q9NQV6 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRDM10Q9NQV6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRDM10Q9NQV6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRDM10Q9NQV6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRDM10Q9NQV6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRDM10Q9NQV6 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRDM10Q9NQV6 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRDM10Q9NQV6 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRDM10Q9NQV6 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRDM10Q9NQV6 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRDM10Q9NQV6 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRDM10Q9NQV6 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRDM10Q9NQV6 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRDM10Q9NQV6 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRDM10Q9NQV6 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRDM10Q9NQV6 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRDM10Q9NQV6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRDM10Q9NQV6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRDM10Q9NQV6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRDM10Q9NQV6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRDM10Q9NQV6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRDM10Q9NQV6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRDM10Q9NQV6 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRDM10Q9NQV6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRDM10Q9NQV6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRDM10Q9NQV6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRDM10Q9NQV6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRDM10Q9NQV6 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRDM10Q9NQV6 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRDM10Q9NQV6 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRDM10Q9NQV6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRDM10Q9NQV6 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRDM10Q9NQV6 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PRDM10Q9NQV6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRDM10Q9NQV6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRDM10Q9NQV6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRDM10Q9NQV6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRDM10Q9NQV6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRDM10Q9NQV6 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRDM10Q9NQV6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRDM10Q9NQV6 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRDM10Q9NQV6 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRDM10Q9NQV6 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRDM10Q9NQV6 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRDM10Q9NQV6 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PRDM10Q9NQV6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRDM10Q9NQV6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PRDM10Q9NQV6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRDM10Q9NQV6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRDM10Q9NQV6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRDM10Q9NQV6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRDM10Q9NQV6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRDM10Q9NQV6 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PRDM10Q9NQV6 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PRDM10Q9NQV6 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRDM10Q9NQV6 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRDM10Q9NQV6 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRDM10Q9NQV6 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PRDM10Q9NQV6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRDM10Q9NQV6 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRDM10Q9NQV6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRDM10Q9NQV6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRDM10Q9NQV6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRDM10Q9NQV6 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRDM10Q9NQV6 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRDM10Q9NQV6 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRDM10Q9NQV6 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRDM10Q9NQV6 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRDM10Q9NQV6 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRDM10Q9NQV6 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRDM10Q9NQV6 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRDM10Q9NQV6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRDM10Q9NQV6 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRDM10Q9NQV6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRDM10Q9NQV6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRDM10Q9NQV6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PRDM10Q9NQV6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRDM10Q9NQV6 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRDM10Q9NQV6 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRDM10Q9NQV6 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRDM10Q9NQV6 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms