Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQT5

EXOSC3, Exosome complex component RRP40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC3Q9NQT5 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EXOSC3Q9NQT5 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
EXOSC3Q9NQT5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
EXOSC3Q9NQT5 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXOSC3Q9NQT5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXOSC3Q9NQT5 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXOSC3Q9NQT5 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXOSC3Q9NQT5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXOSC3Q9NQT5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXOSC3Q9NQT5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
EXOSC3Q9NQT5 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXOSC3Q9NQT5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXOSC3Q9NQT5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXOSC3Q9NQT5 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXOSC3Q9NQT5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
EXOSC3Q9NQT5 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXOSC3Q9NQT5 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXOSC3Q9NQT5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXOSC3Q9NQT5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXOSC3Q9NQT5 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXOSC3Q9NQT5 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXOSC3Q9NQT5 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXOSC3Q9NQT5 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
EXOSC3Q9NQT5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EXOSC3Q9NQT5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EXOSC3Q9NQT5 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EXOSC3Q9NQT5 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EXOSC3Q9NQT5 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EXOSC3Q9NQT5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EXOSC3Q9NQT5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EXOSC3Q9NQT5 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EXOSC3Q9NQT5 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EXOSC3Q9NQT5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EXOSC3Q9NQT5 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EXOSC3Q9NQT5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EXOSC3Q9NQT5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EXOSC3Q9NQT5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EXOSC3Q9NQT5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EXOSC3Q9NQT5 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EXOSC3Q9NQT5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EXOSC3Q9NQT5 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EXOSC3Q9NQT5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EXOSC3Q9NQT5 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EXOSC3Q9NQT5 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
EXOSC3Q9NQT5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EXOSC3Q9NQT5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EXOSC3Q9NQT5 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EXOSC3Q9NQT5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EXOSC3Q9NQT5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EXOSC3Q9NQT5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
EXOSC3Q9NQT5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EXOSC3Q9NQT5 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EXOSC3Q9NQT5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EXOSC3Q9NQT5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EXOSC3Q9NQT5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EXOSC3Q9NQT5 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EXOSC3Q9NQT5 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EXOSC3Q9NQT5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EXOSC3Q9NQT5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EXOSC3Q9NQT5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EXOSC3Q9NQT5 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EXOSC3Q9NQT5 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EXOSC3Q9NQT5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EXOSC3Q9NQT5 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
EXOSC3Q9NQT5 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EXOSC3Q9NQT5 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EXOSC3Q9NQT5 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EXOSC3Q9NQT5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EXOSC3Q9NQT5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EXOSC3Q9NQT5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EXOSC3Q9NQT5 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EXOSC3Q9NQT5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EXOSC3Q9NQT5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EXOSC3Q9NQT5 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EXOSC3Q9NQT5 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EXOSC3Q9NQT5 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EXOSC3Q9NQT5 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EXOSC3Q9NQT5 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EXOSC3Q9NQT5 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EXOSC3Q9NQT5 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EXOSC3Q9NQT5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EXOSC3Q9NQT5 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EXOSC3Q9NQT5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EXOSC3Q9NQT5 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EXOSC3Q9NQT5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
EXOSC3Q9NQT5 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EXOSC3Q9NQT5 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EXOSC3Q9NQT5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EXOSC3Q9NQT5 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
EXOSC3Q9NQT5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
EXOSC3Q9NQT5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
EXOSC3Q9NQT5 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
EXOSC3Q9NQT5 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EXOSC3Q9NQT5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EXOSC3Q9NQT5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
EXOSC3Q9NQT5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EXOSC3Q9NQT5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
EXOSC3Q9NQT5 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
EXOSC3Q9NQT5 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
EXOSC3Q9NQT5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms