Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
LHX9Q9NQ69 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LHX9Q9NQ69 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LHX9Q9NQ69 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LHX9Q9NQ69 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LHX9Q9NQ69 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LHX9Q9NQ69 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LHX9Q9NQ69 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LHX9Q9NQ69 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LHX9Q9NQ69 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LHX9Q9NQ69 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LHX9Q9NQ69 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
LHX9Q9NQ69 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LHX9Q9NQ69 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LHX9Q9NQ69 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LHX9Q9NQ69 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LHX9Q9NQ69 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LHX9Q9NQ69 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LHX9Q9NQ69 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LHX9Q9NQ69 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LHX9Q9NQ69 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LHX9Q9NQ69 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
LHX9Q9NQ69 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LHX9Q9NQ69 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LHX9Q9NQ69 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LHX9Q9NQ69 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LHX9Q9NQ69 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LHX9Q9NQ69 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LHX9Q9NQ69 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LHX9Q9NQ69 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LHX9Q9NQ69 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LHX9Q9NQ69 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LHX9Q9NQ69 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LHX9Q9NQ69 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LHX9Q9NQ69 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LHX9Q9NQ69 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LHX9Q9NQ69 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
LHX9Q9NQ69 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LHX9Q9NQ69 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LHX9Q9NQ69 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LHX9Q9NQ69 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LHX9Q9NQ69 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LHX9Q9NQ69 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LHX9Q9NQ69 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LHX9Q9NQ69 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LHX9Q9NQ69 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LHX9Q9NQ69 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LHX9Q9NQ69 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LHX9Q9NQ69 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LHX9Q9NQ69 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LHX9Q9NQ69 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LHX9Q9NQ69 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LHX9Q9NQ69 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LHX9Q9NQ69 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LHX9Q9NQ69 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LHX9Q9NQ69 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LHX9Q9NQ69 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LHX9Q9NQ69 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
LHX9Q9NQ69 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LHX9Q9NQ69 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LHX9Q9NQ69 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LHX9Q9NQ69 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LHX9Q9NQ69 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LHX9Q9NQ69 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LHX9Q9NQ69 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LHX9Q9NQ69 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LHX9Q9NQ69 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LHX9Q9NQ69 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LHX9Q9NQ69 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LHX9Q9NQ69 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LHX9Q9NQ69 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LHX9Q9NQ69 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
LHX9Q9NQ69 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LHX9Q9NQ69 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LHX9Q9NQ69 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LHX9Q9NQ69 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LHX9Q9NQ69 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LHX9Q9NQ69 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LHX9Q9NQ69 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LHX9Q9NQ69 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LHX9Q9NQ69 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LHX9Q9NQ69 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LHX9Q9NQ69 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LHX9Q9NQ69 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LHX9Q9NQ69 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LHX9Q9NQ69 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
LHX9Q9NQ69 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LHX9Q9NQ69 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LHX9Q9NQ69 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LHX9Q9NQ69 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LHX9Q9NQ69 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LHX9Q9NQ69 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LHX9Q9NQ69 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LHX9Q9NQ69 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LHX9Q9NQ69 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LHX9Q9NQ69 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LHX9Q9NQ69 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LHX9Q9NQ69 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
LHX9Q9NQ69 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
LHX9Q9NQ69 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
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