Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NRIP3Q9NQ35 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NRIP3Q9NQ35 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NRIP3Q9NQ35 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NRIP3Q9NQ35 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NRIP3Q9NQ35 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NRIP3Q9NQ35 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NRIP3Q9NQ35 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NRIP3Q9NQ35 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NRIP3Q9NQ35 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NRIP3Q9NQ35 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NRIP3Q9NQ35 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NRIP3Q9NQ35 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NRIP3Q9NQ35 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NRIP3Q9NQ35 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NRIP3Q9NQ35 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NRIP3Q9NQ35 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NRIP3Q9NQ35 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NRIP3Q9NQ35 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NRIP3Q9NQ35 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NRIP3Q9NQ35 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NRIP3Q9NQ35 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NRIP3Q9NQ35 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NRIP3Q9NQ35 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NRIP3Q9NQ35 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NRIP3Q9NQ35 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NRIP3Q9NQ35 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NRIP3Q9NQ35 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NRIP3Q9NQ35 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NRIP3Q9NQ35 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NRIP3Q9NQ35 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NRIP3Q9NQ35 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NRIP3Q9NQ35 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NRIP3Q9NQ35 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NRIP3Q9NQ35 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NRIP3Q9NQ35 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NRIP3Q9NQ35 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NRIP3Q9NQ35 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NRIP3Q9NQ35 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NRIP3Q9NQ35 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NRIP3Q9NQ35 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NRIP3Q9NQ35 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NRIP3Q9NQ35 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NRIP3Q9NQ35 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NRIP3Q9NQ35 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NRIP3Q9NQ35 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NRIP3Q9NQ35 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NRIP3Q9NQ35 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NRIP3Q9NQ35 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NRIP3Q9NQ35 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NRIP3Q9NQ35 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NRIP3Q9NQ35 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NRIP3Q9NQ35 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NRIP3Q9NQ35 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NRIP3Q9NQ35 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NRIP3Q9NQ35 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NRIP3Q9NQ35 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NRIP3Q9NQ35 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NRIP3Q9NQ35 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NRIP3Q9NQ35 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NRIP3Q9NQ35 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NRIP3Q9NQ35 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NRIP3Q9NQ35 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NRIP3Q9NQ35 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NRIP3Q9NQ35 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NRIP3Q9NQ35 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NRIP3Q9NQ35 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
NRIP3Q9NQ35 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NRIP3Q9NQ35 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NRIP3Q9NQ35 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NRIP3Q9NQ35 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NRIP3Q9NQ35 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NRIP3Q9NQ35 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NRIP3Q9NQ35 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NRIP3Q9NQ35 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NRIP3Q9NQ35 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
NRIP3Q9NQ35 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NRIP3Q9NQ35 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NRIP3Q9NQ35 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NRIP3Q9NQ35 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
NRIP3Q9NQ35 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NRIP3Q9NQ35 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NRIP3Q9NQ35 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NRIP3Q9NQ35 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NRIP3Q9NQ35 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NRIP3Q9NQ35 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NRIP3Q9NQ35 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NRIP3Q9NQ35 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NRIP3Q9NQ35 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NRIP3Q9NQ35 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NRIP3Q9NQ35 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NRIP3Q9NQ35 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NRIP3Q9NQ35 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NRIP3Q9NQ35 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NRIP3Q9NQ35 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NRIP3Q9NQ35 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NRIP3Q9NQ35 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NRIP3Q9NQ35 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NRIP3Q9NQ35 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NRIP3Q9NQ35 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms