Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TIMMDC1Q9NPL8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TIMMDC1Q9NPL8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TIMMDC1Q9NPL8 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TIMMDC1Q9NPL8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TIMMDC1Q9NPL8 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TIMMDC1Q9NPL8 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TIMMDC1Q9NPL8 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TIMMDC1Q9NPL8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TIMMDC1Q9NPL8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TIMMDC1Q9NPL8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TIMMDC1Q9NPL8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TIMMDC1Q9NPL8 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TIMMDC1Q9NPL8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TIMMDC1Q9NPL8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TIMMDC1Q9NPL8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TIMMDC1Q9NPL8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TIMMDC1Q9NPL8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TIMMDC1Q9NPL8 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TIMMDC1Q9NPL8 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TIMMDC1Q9NPL8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TIMMDC1Q9NPL8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TIMMDC1Q9NPL8 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TIMMDC1Q9NPL8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TIMMDC1Q9NPL8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TIMMDC1Q9NPL8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TIMMDC1Q9NPL8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TIMMDC1Q9NPL8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TIMMDC1Q9NPL8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TIMMDC1Q9NPL8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TIMMDC1Q9NPL8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TIMMDC1Q9NPL8 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TIMMDC1Q9NPL8 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TIMMDC1Q9NPL8 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TIMMDC1Q9NPL8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TIMMDC1Q9NPL8 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TIMMDC1Q9NPL8 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TIMMDC1Q9NPL8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TIMMDC1Q9NPL8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TIMMDC1Q9NPL8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TIMMDC1Q9NPL8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TIMMDC1Q9NPL8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TIMMDC1Q9NPL8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TIMMDC1Q9NPL8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TIMMDC1Q9NPL8 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TIMMDC1Q9NPL8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TIMMDC1Q9NPL8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TIMMDC1Q9NPL8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TIMMDC1Q9NPL8 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TIMMDC1Q9NPL8 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TIMMDC1Q9NPL8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TIMMDC1Q9NPL8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TIMMDC1Q9NPL8 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TIMMDC1Q9NPL8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TIMMDC1Q9NPL8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TIMMDC1Q9NPL8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TIMMDC1Q9NPL8 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TIMMDC1Q9NPL8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TIMMDC1Q9NPL8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TIMMDC1Q9NPL8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TIMMDC1Q9NPL8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TIMMDC1Q9NPL8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TIMMDC1Q9NPL8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TIMMDC1Q9NPL8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TIMMDC1Q9NPL8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TIMMDC1Q9NPL8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TIMMDC1Q9NPL8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TIMMDC1Q9NPL8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TIMMDC1Q9NPL8 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TIMMDC1Q9NPL8 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TIMMDC1Q9NPL8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TIMMDC1Q9NPL8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TIMMDC1Q9NPL8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TIMMDC1Q9NPL8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TIMMDC1Q9NPL8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TIMMDC1Q9NPL8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TIMMDC1Q9NPL8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TIMMDC1Q9NPL8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TIMMDC1Q9NPL8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TIMMDC1Q9NPL8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TIMMDC1Q9NPL8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TIMMDC1Q9NPL8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TIMMDC1Q9NPL8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TIMMDC1Q9NPL8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TIMMDC1Q9NPL8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TIMMDC1Q9NPL8 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TIMMDC1Q9NPL8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TIMMDC1Q9NPL8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TIMMDC1Q9NPL8 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TIMMDC1Q9NPL8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TIMMDC1Q9NPL8 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TIMMDC1Q9NPL8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TIMMDC1Q9NPL8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TIMMDC1Q9NPL8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TIMMDC1Q9NPL8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TIMMDC1Q9NPL8 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TIMMDC1Q9NPL8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms