Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB9BQ9NP90 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB9BQ9NP90 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB9BQ9NP90 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB9BQ9NP90 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB9BQ9NP90 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB9BQ9NP90 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB9BQ9NP90 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB9BQ9NP90 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB9BQ9NP90 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB9BQ9NP90 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB9BQ9NP90 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB9BQ9NP90 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB9BQ9NP90 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB9BQ9NP90 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB9BQ9NP90 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB9BQ9NP90 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB9BQ9NP90 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB9BQ9NP90 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB9BQ9NP90 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB9BQ9NP90 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB9BQ9NP90 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB9BQ9NP90 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB9BQ9NP90 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB9BQ9NP90 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB9BQ9NP90 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB9BQ9NP90 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB9BQ9NP90 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB9BQ9NP90 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB9BQ9NP90 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB9BQ9NP90 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB9BQ9NP90 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB9BQ9NP90 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB9BQ9NP90 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB9BQ9NP90 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB9BQ9NP90 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB9BQ9NP90 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB9BQ9NP90 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB9BQ9NP90 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB9BQ9NP90 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB9BQ9NP90 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB9BQ9NP90 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB9BQ9NP90 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB9BQ9NP90 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
RAB9BQ9NP90 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RAB9BQ9NP90 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB9BQ9NP90 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB9BQ9NP90 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB9BQ9NP90 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB9BQ9NP90 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB9BQ9NP90 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB9BQ9NP90 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB9BQ9NP90 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB9BQ9NP90 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB9BQ9NP90 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB9BQ9NP90 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB9BQ9NP90 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB9BQ9NP90 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB9BQ9NP90 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB9BQ9NP90 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB9BQ9NP90 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB9BQ9NP90 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB9BQ9NP90 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB9BQ9NP90 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB9BQ9NP90 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB9BQ9NP90 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB9BQ9NP90 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB9BQ9NP90 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB9BQ9NP90 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB9BQ9NP90 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB9BQ9NP90 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB9BQ9NP90 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB9BQ9NP90 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB9BQ9NP90 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB9BQ9NP90 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB9BQ9NP90 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB9BQ9NP90 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB9BQ9NP90 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB9BQ9NP90 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB9BQ9NP90 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB9BQ9NP90 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB9BQ9NP90 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB9BQ9NP90 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB9BQ9NP90 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB9BQ9NP90 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB9BQ9NP90 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB9BQ9NP90 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB9BQ9NP90 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB9BQ9NP90 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB9BQ9NP90 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB9BQ9NP90 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB9BQ9NP90 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB9BQ9NP90 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB9BQ9NP90 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB9BQ9NP90 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB9BQ9NP90 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB9BQ9NP90 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB9BQ9NP90 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB9BQ9NP90 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB9BQ9NP90 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms