Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNZ6

PRM3, Protamine-3, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRM3Q9NNZ6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRM3Q9NNZ6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRM3Q9NNZ6 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRM3Q9NNZ6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRM3Q9NNZ6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRM3Q9NNZ6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRM3Q9NNZ6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRM3Q9NNZ6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRM3Q9NNZ6 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRM3Q9NNZ6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRM3Q9NNZ6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRM3Q9NNZ6 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRM3Q9NNZ6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRM3Q9NNZ6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRM3Q9NNZ6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRM3Q9NNZ6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRM3Q9NNZ6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRM3Q9NNZ6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PRM3Q9NNZ6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRM3Q9NNZ6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRM3Q9NNZ6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PRM3Q9NNZ6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRM3Q9NNZ6 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRM3Q9NNZ6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRM3Q9NNZ6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRM3Q9NNZ6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRM3Q9NNZ6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRM3Q9NNZ6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRM3Q9NNZ6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRM3Q9NNZ6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRM3Q9NNZ6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRM3Q9NNZ6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRM3Q9NNZ6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRM3Q9NNZ6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRM3Q9NNZ6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRM3Q9NNZ6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRM3Q9NNZ6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRM3Q9NNZ6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRM3Q9NNZ6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PRM3Q9NNZ6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRM3Q9NNZ6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRM3Q9NNZ6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PRM3Q9NNZ6 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRM3Q9NNZ6 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRM3Q9NNZ6 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRM3Q9NNZ6 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRM3Q9NNZ6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRM3Q9NNZ6 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRM3Q9NNZ6 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRM3Q9NNZ6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRM3Q9NNZ6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRM3Q9NNZ6 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRM3Q9NNZ6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRM3Q9NNZ6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRM3Q9NNZ6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRM3Q9NNZ6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRM3Q9NNZ6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRM3Q9NNZ6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRM3Q9NNZ6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRM3Q9NNZ6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRM3Q9NNZ6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRM3Q9NNZ6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRM3Q9NNZ6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PRM3Q9NNZ6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRM3Q9NNZ6 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRM3Q9NNZ6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRM3Q9NNZ6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRM3Q9NNZ6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRM3Q9NNZ6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRM3Q9NNZ6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRM3Q9NNZ6 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRM3Q9NNZ6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRM3Q9NNZ6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRM3Q9NNZ6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRM3Q9NNZ6 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRM3Q9NNZ6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRM3Q9NNZ6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRM3Q9NNZ6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRM3Q9NNZ6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRM3Q9NNZ6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRM3Q9NNZ6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRM3Q9NNZ6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRM3Q9NNZ6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PRM3Q9NNZ6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRM3Q9NNZ6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PRM3Q9NNZ6 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRM3Q9NNZ6 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRM3Q9NNZ6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRM3Q9NNZ6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRM3Q9NNZ6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRM3Q9NNZ6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRM3Q9NNZ6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRM3Q9NNZ6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRM3Q9NNZ6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRM3Q9NNZ6 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRM3Q9NNZ6 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRM3Q9NNZ6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRM3Q9NNZ6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRM3Q9NNZ6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRM3Q9NNZ6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms