Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU8

POLD4, DNA polymerase delta subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD4Q9HCU8 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
POLD4Q9HCU8 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLD4Q9HCU8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLD4Q9HCU8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLD4Q9HCU8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLD4Q9HCU8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLD4Q9HCU8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
POLD4Q9HCU8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLD4Q9HCU8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLD4Q9HCU8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLD4Q9HCU8 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLD4Q9HCU8 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
POLD4Q9HCU8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLD4Q9HCU8 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
POLD4Q9HCU8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLD4Q9HCU8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLD4Q9HCU8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
POLD4Q9HCU8 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLD4Q9HCU8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLD4Q9HCU8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLD4Q9HCU8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLD4Q9HCU8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLD4Q9HCU8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLD4Q9HCU8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLD4Q9HCU8 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLD4Q9HCU8 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLD4Q9HCU8 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLD4Q9HCU8 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLD4Q9HCU8 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLD4Q9HCU8 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
POLD4Q9HCU8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLD4Q9HCU8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLD4Q9HCU8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLD4Q9HCU8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLD4Q9HCU8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLD4Q9HCU8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLD4Q9HCU8 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLD4Q9HCU8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLD4Q9HCU8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLD4Q9HCU8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLD4Q9HCU8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLD4Q9HCU8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLD4Q9HCU8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLD4Q9HCU8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLD4Q9HCU8 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
POLD4Q9HCU8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLD4Q9HCU8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLD4Q9HCU8 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLD4Q9HCU8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLD4Q9HCU8 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLD4Q9HCU8 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLD4Q9HCU8 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLD4Q9HCU8 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLD4Q9HCU8 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
POLD4Q9HCU8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLD4Q9HCU8 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLD4Q9HCU8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLD4Q9HCU8 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLD4Q9HCU8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLD4Q9HCU8 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLD4Q9HCU8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLD4Q9HCU8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLD4Q9HCU8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLD4Q9HCU8 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLD4Q9HCU8 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLD4Q9HCU8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLD4Q9HCU8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
POLD4Q9HCU8 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLD4Q9HCU8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLD4Q9HCU8 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLD4Q9HCU8 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLD4Q9HCU8 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLD4Q9HCU8 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
POLD4Q9HCU8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLD4Q9HCU8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLD4Q9HCU8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLD4Q9HCU8 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLD4Q9HCU8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLD4Q9HCU8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLD4Q9HCU8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLD4Q9HCU8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLD4Q9HCU8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLD4Q9HCU8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLD4Q9HCU8 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLD4Q9HCU8 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLD4Q9HCU8 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLD4Q9HCU8 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLD4Q9HCU8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLD4Q9HCU8 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLD4Q9HCU8 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLD4Q9HCU8 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLD4Q9HCU8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLD4Q9HCU8 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLD4Q9HCU8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
POLD4Q9HCU8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLD4Q9HCU8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
POLD4Q9HCU8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLD4Q9HCU8 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLD4Q9HCU8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLD4Q9HCU8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms