Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ3

RAVER2, Ribonucleoprotein PTB-binding 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAVER2Q9HCJ3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAVER2Q9HCJ3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAVER2Q9HCJ3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAVER2Q9HCJ3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAVER2Q9HCJ3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAVER2Q9HCJ3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAVER2Q9HCJ3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAVER2Q9HCJ3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAVER2Q9HCJ3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAVER2Q9HCJ3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAVER2Q9HCJ3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAVER2Q9HCJ3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAVER2Q9HCJ3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAVER2Q9HCJ3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAVER2Q9HCJ3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAVER2Q9HCJ3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAVER2Q9HCJ3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAVER2Q9HCJ3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAVER2Q9HCJ3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAVER2Q9HCJ3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAVER2Q9HCJ3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAVER2Q9HCJ3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAVER2Q9HCJ3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAVER2Q9HCJ3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAVER2Q9HCJ3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAVER2Q9HCJ3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAVER2Q9HCJ3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAVER2Q9HCJ3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAVER2Q9HCJ3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAVER2Q9HCJ3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAVER2Q9HCJ3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAVER2Q9HCJ3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAVER2Q9HCJ3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAVER2Q9HCJ3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAVER2Q9HCJ3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAVER2Q9HCJ3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAVER2Q9HCJ3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAVER2Q9HCJ3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAVER2Q9HCJ3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAVER2Q9HCJ3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAVER2Q9HCJ3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAVER2Q9HCJ3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAVER2Q9HCJ3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAVER2Q9HCJ3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAVER2Q9HCJ3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAVER2Q9HCJ3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAVER2Q9HCJ3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAVER2Q9HCJ3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAVER2Q9HCJ3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAVER2Q9HCJ3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAVER2Q9HCJ3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAVER2Q9HCJ3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RAVER2Q9HCJ3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RAVER2Q9HCJ3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAVER2Q9HCJ3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAVER2Q9HCJ3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAVER2Q9HCJ3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAVER2Q9HCJ3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAVER2Q9HCJ3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAVER2Q9HCJ3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RAVER2Q9HCJ3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAVER2Q9HCJ3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RAVER2Q9HCJ3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAVER2Q9HCJ3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAVER2Q9HCJ3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAVER2Q9HCJ3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAVER2Q9HCJ3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAVER2Q9HCJ3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAVER2Q9HCJ3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAVER2Q9HCJ3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAVER2Q9HCJ3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAVER2Q9HCJ3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAVER2Q9HCJ3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAVER2Q9HCJ3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAVER2Q9HCJ3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAVER2Q9HCJ3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAVER2Q9HCJ3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAVER2Q9HCJ3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAVER2Q9HCJ3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAVER2Q9HCJ3 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAVER2Q9HCJ3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAVER2Q9HCJ3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAVER2Q9HCJ3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAVER2Q9HCJ3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAVER2Q9HCJ3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAVER2Q9HCJ3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAVER2Q9HCJ3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAVER2Q9HCJ3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RAVER2Q9HCJ3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAVER2Q9HCJ3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAVER2Q9HCJ3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAVER2Q9HCJ3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAVER2Q9HCJ3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAVER2Q9HCJ3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAVER2Q9HCJ3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAVER2Q9HCJ3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAVER2Q9HCJ3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RAVER2Q9HCJ3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAVER2Q9HCJ3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAVER2Q9HCJ3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms