Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9E3

COG4, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 4, humanhuman

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Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG4Q9H9E3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COG4Q9H9E3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
COG4Q9H9E3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
COG4Q9H9E3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COG4Q9H9E3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
COG4Q9H9E3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COG4Q9H9E3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COG4Q9H9E3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COG4Q9H9E3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COG4Q9H9E3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COG4Q9H9E3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COG4Q9H9E3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COG4Q9H9E3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COG4Q9H9E3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COG4Q9H9E3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COG4Q9H9E3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
COG4Q9H9E3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COG4Q9H9E3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COG4Q9H9E3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COG4Q9H9E3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COG4Q9H9E3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COG4Q9H9E3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COG4Q9H9E3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COG4Q9H9E3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COG4Q9H9E3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COG4Q9H9E3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COG4Q9H9E3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COG4Q9H9E3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COG4Q9H9E3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COG4Q9H9E3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COG4Q9H9E3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COG4Q9H9E3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COG4Q9H9E3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COG4Q9H9E3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COG4Q9H9E3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COG4Q9H9E3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COG4Q9H9E3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COG4Q9H9E3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COG4Q9H9E3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COG4Q9H9E3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COG4Q9H9E3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COG4Q9H9E3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COG4Q9H9E3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COG4Q9H9E3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
COG4Q9H9E3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COG4Q9H9E3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COG4Q9H9E3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COG4Q9H9E3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COG4Q9H9E3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COG4Q9H9E3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COG4Q9H9E3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COG4Q9H9E3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
COG4Q9H9E3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
COG4Q9H9E3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
COG4Q9H9E3 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COG4Q9H9E3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COG4Q9H9E3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COG4Q9H9E3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COG4Q9H9E3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COG4Q9H9E3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COG4Q9H9E3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COG4Q9H9E3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COG4Q9H9E3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COG4Q9H9E3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COG4Q9H9E3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COG4Q9H9E3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COG4Q9H9E3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COG4Q9H9E3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COG4Q9H9E3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COG4Q9H9E3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COG4Q9H9E3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COG4Q9H9E3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COG4Q9H9E3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COG4Q9H9E3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COG4Q9H9E3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COG4Q9H9E3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COG4Q9H9E3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COG4Q9H9E3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COG4Q9H9E3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COG4Q9H9E3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COG4Q9H9E3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COG4Q9H9E3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COG4Q9H9E3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COG4Q9H9E3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COG4Q9H9E3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COG4Q9H9E3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COG4Q9H9E3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COG4Q9H9E3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COG4Q9H9E3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COG4Q9H9E3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COG4Q9H9E3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COG4Q9H9E3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COG4Q9H9E3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COG4Q9H9E3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COG4Q9H9E3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COG4Q9H9E3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COG4Q9H9E3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COG4Q9H9E3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COG4Q9H9E3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COG4Q9H9E3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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