Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8K7

C10orf88, Uncharacterized protein C10orf88, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf88Q9H8K7 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
C10orf88Q9H8K7 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C10orf88Q9H8K7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C10orf88Q9H8K7 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C10orf88Q9H8K7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C10orf88Q9H8K7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C10orf88Q9H8K7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C10orf88Q9H8K7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C10orf88Q9H8K7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C10orf88Q9H8K7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C10orf88Q9H8K7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
C10orf88Q9H8K7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C10orf88Q9H8K7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C10orf88Q9H8K7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
C10orf88Q9H8K7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22■■□□□ 1.11
C10orf88Q9H8K7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
C10orf88Q9H8K7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
C10orf88Q9H8K7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C10orf88Q9H8K7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C10orf88Q9H8K7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C10orf88Q9H8K7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C10orf88Q9H8K7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C10orf88Q9H8K7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C10orf88Q9H8K7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C10orf88Q9H8K7 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C10orf88Q9H8K7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C10orf88Q9H8K7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C10orf88Q9H8K7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
C10orf88Q9H8K7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
C10orf88Q9H8K7 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C10orf88Q9H8K7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C10orf88Q9H8K7 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
C10orf88Q9H8K7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C10orf88Q9H8K7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C10orf88Q9H8K7 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C10orf88Q9H8K7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C10orf88Q9H8K7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C10orf88Q9H8K7 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C10orf88Q9H8K7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C10orf88Q9H8K7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C10orf88Q9H8K7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C10orf88Q9H8K7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C10orf88Q9H8K7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
C10orf88Q9H8K7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C10orf88Q9H8K7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C10orf88Q9H8K7 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C10orf88Q9H8K7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C10orf88Q9H8K7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C10orf88Q9H8K7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C10orf88Q9H8K7 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C10orf88Q9H8K7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
C10orf88Q9H8K7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C10orf88Q9H8K7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C10orf88Q9H8K7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C10orf88Q9H8K7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C10orf88Q9H8K7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C10orf88Q9H8K7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
C10orf88Q9H8K7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C10orf88Q9H8K7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C10orf88Q9H8K7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C10orf88Q9H8K7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C10orf88Q9H8K7 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C10orf88Q9H8K7 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C10orf88Q9H8K7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C10orf88Q9H8K7 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C10orf88Q9H8K7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C10orf88Q9H8K7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
C10orf88Q9H8K7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
C10orf88Q9H8K7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C10orf88Q9H8K7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C10orf88Q9H8K7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C10orf88Q9H8K7 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C10orf88Q9H8K7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C10orf88Q9H8K7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C10orf88Q9H8K7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C10orf88Q9H8K7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C10orf88Q9H8K7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C10orf88Q9H8K7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C10orf88Q9H8K7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C10orf88Q9H8K7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
C10orf88Q9H8K7 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
C10orf88Q9H8K7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C10orf88Q9H8K7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C10orf88Q9H8K7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C10orf88Q9H8K7 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C10orf88Q9H8K7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C10orf88Q9H8K7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C10orf88Q9H8K7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C10orf88Q9H8K7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C10orf88Q9H8K7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C10orf88Q9H8K7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
C10orf88Q9H8K7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C10orf88Q9H8K7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C10orf88Q9H8K7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C10orf88Q9H8K7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C10orf88Q9H8K7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
C10orf88Q9H8K7 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C10orf88Q9H8K7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C10orf88Q9H8K7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C10orf88Q9H8K7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms