Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7B4

SMYD3, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD3Q9H7B4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMYD3Q9H7B4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMYD3Q9H7B4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMYD3Q9H7B4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMYD3Q9H7B4 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMYD3Q9H7B4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMYD3Q9H7B4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMYD3Q9H7B4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMYD3Q9H7B4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMYD3Q9H7B4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMYD3Q9H7B4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMYD3Q9H7B4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMYD3Q9H7B4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMYD3Q9H7B4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMYD3Q9H7B4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMYD3Q9H7B4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMYD3Q9H7B4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMYD3Q9H7B4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMYD3Q9H7B4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMYD3Q9H7B4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMYD3Q9H7B4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SMYD3Q9H7B4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMYD3Q9H7B4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMYD3Q9H7B4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMYD3Q9H7B4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMYD3Q9H7B4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMYD3Q9H7B4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMYD3Q9H7B4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMYD3Q9H7B4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMYD3Q9H7B4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMYD3Q9H7B4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMYD3Q9H7B4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMYD3Q9H7B4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMYD3Q9H7B4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMYD3Q9H7B4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMYD3Q9H7B4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMYD3Q9H7B4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMYD3Q9H7B4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMYD3Q9H7B4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMYD3Q9H7B4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMYD3Q9H7B4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SMYD3Q9H7B4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMYD3Q9H7B4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMYD3Q9H7B4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMYD3Q9H7B4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMYD3Q9H7B4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMYD3Q9H7B4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMYD3Q9H7B4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMYD3Q9H7B4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMYD3Q9H7B4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMYD3Q9H7B4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMYD3Q9H7B4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMYD3Q9H7B4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMYD3Q9H7B4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SMYD3Q9H7B4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMYD3Q9H7B4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMYD3Q9H7B4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMYD3Q9H7B4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMYD3Q9H7B4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMYD3Q9H7B4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMYD3Q9H7B4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SMYD3Q9H7B4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMYD3Q9H7B4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMYD3Q9H7B4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMYD3Q9H7B4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMYD3Q9H7B4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMYD3Q9H7B4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMYD3Q9H7B4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMYD3Q9H7B4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMYD3Q9H7B4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMYD3Q9H7B4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMYD3Q9H7B4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMYD3Q9H7B4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMYD3Q9H7B4 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMYD3Q9H7B4 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMYD3Q9H7B4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMYD3Q9H7B4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMYD3Q9H7B4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMYD3Q9H7B4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMYD3Q9H7B4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMYD3Q9H7B4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SMYD3Q9H7B4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMYD3Q9H7B4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMYD3Q9H7B4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMYD3Q9H7B4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SMYD3Q9H7B4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMYD3Q9H7B4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMYD3Q9H7B4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMYD3Q9H7B4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SMYD3Q9H7B4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMYD3Q9H7B4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SMYD3Q9H7B4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMYD3Q9H7B4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMYD3Q9H7B4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMYD3Q9H7B4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMYD3Q9H7B4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMYD3Q9H7B4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMYD3Q9H7B4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMYD3Q9H7B4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMYD3Q9H7B4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms