Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4I3

TRABD, TraB domain-containing protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRABDQ9H4I3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRABDQ9H4I3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRABDQ9H4I3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRABDQ9H4I3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRABDQ9H4I3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TRABDQ9H4I3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRABDQ9H4I3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRABDQ9H4I3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRABDQ9H4I3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRABDQ9H4I3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRABDQ9H4I3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRABDQ9H4I3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRABDQ9H4I3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRABDQ9H4I3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TRABDQ9H4I3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRABDQ9H4I3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRABDQ9H4I3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRABDQ9H4I3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRABDQ9H4I3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRABDQ9H4I3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRABDQ9H4I3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRABDQ9H4I3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRABDQ9H4I3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRABDQ9H4I3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TRABDQ9H4I3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRABDQ9H4I3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRABDQ9H4I3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TRABDQ9H4I3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TRABDQ9H4I3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRABDQ9H4I3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRABDQ9H4I3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRABDQ9H4I3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRABDQ9H4I3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRABDQ9H4I3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRABDQ9H4I3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRABDQ9H4I3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRABDQ9H4I3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRABDQ9H4I3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRABDQ9H4I3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRABDQ9H4I3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRABDQ9H4I3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRABDQ9H4I3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRABDQ9H4I3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRABDQ9H4I3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRABDQ9H4I3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRABDQ9H4I3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TRABDQ9H4I3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRABDQ9H4I3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRABDQ9H4I3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRABDQ9H4I3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRABDQ9H4I3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRABDQ9H4I3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRABDQ9H4I3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TRABDQ9H4I3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TRABDQ9H4I3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRABDQ9H4I3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRABDQ9H4I3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRABDQ9H4I3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRABDQ9H4I3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRABDQ9H4I3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TRABDQ9H4I3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TRABDQ9H4I3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRABDQ9H4I3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TRABDQ9H4I3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TRABDQ9H4I3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRABDQ9H4I3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRABDQ9H4I3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRABDQ9H4I3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRABDQ9H4I3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRABDQ9H4I3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRABDQ9H4I3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRABDQ9H4I3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRABDQ9H4I3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRABDQ9H4I3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRABDQ9H4I3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRABDQ9H4I3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRABDQ9H4I3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRABDQ9H4I3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TRABDQ9H4I3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRABDQ9H4I3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRABDQ9H4I3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRABDQ9H4I3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRABDQ9H4I3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRABDQ9H4I3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRABDQ9H4I3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRABDQ9H4I3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRABDQ9H4I3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRABDQ9H4I3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRABDQ9H4I3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRABDQ9H4I3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRABDQ9H4I3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRABDQ9H4I3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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