Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2C1

LHX5, LIM/homeobox protein Lhx5, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX5Q9H2C1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LHX5Q9H2C1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LHX5Q9H2C1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LHX5Q9H2C1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LHX5Q9H2C1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LHX5Q9H2C1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LHX5Q9H2C1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LHX5Q9H2C1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LHX5Q9H2C1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LHX5Q9H2C1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LHX5Q9H2C1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LHX5Q9H2C1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LHX5Q9H2C1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LHX5Q9H2C1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LHX5Q9H2C1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LHX5Q9H2C1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LHX5Q9H2C1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LHX5Q9H2C1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LHX5Q9H2C1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LHX5Q9H2C1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LHX5Q9H2C1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LHX5Q9H2C1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LHX5Q9H2C1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LHX5Q9H2C1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LHX5Q9H2C1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LHX5Q9H2C1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LHX5Q9H2C1 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LHX5Q9H2C1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LHX5Q9H2C1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LHX5Q9H2C1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LHX5Q9H2C1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LHX5Q9H2C1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LHX5Q9H2C1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LHX5Q9H2C1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LHX5Q9H2C1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LHX5Q9H2C1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LHX5Q9H2C1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LHX5Q9H2C1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LHX5Q9H2C1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LHX5Q9H2C1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LHX5Q9H2C1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LHX5Q9H2C1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LHX5Q9H2C1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LHX5Q9H2C1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LHX5Q9H2C1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LHX5Q9H2C1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LHX5Q9H2C1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LHX5Q9H2C1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LHX5Q9H2C1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LHX5Q9H2C1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LHX5Q9H2C1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LHX5Q9H2C1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LHX5Q9H2C1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LHX5Q9H2C1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LHX5Q9H2C1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LHX5Q9H2C1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LHX5Q9H2C1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LHX5Q9H2C1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LHX5Q9H2C1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LHX5Q9H2C1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LHX5Q9H2C1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LHX5Q9H2C1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LHX5Q9H2C1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LHX5Q9H2C1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LHX5Q9H2C1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LHX5Q9H2C1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LHX5Q9H2C1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LHX5Q9H2C1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LHX5Q9H2C1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LHX5Q9H2C1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LHX5Q9H2C1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LHX5Q9H2C1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LHX5Q9H2C1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LHX5Q9H2C1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LHX5Q9H2C1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LHX5Q9H2C1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LHX5Q9H2C1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LHX5Q9H2C1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LHX5Q9H2C1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LHX5Q9H2C1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LHX5Q9H2C1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LHX5Q9H2C1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LHX5Q9H2C1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LHX5Q9H2C1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LHX5Q9H2C1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LHX5Q9H2C1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LHX5Q9H2C1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LHX5Q9H2C1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LHX5Q9H2C1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
LHX5Q9H2C1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
LHX5Q9H2C1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
LHX5Q9H2C1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LHX5Q9H2C1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LHX5Q9H2C1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LHX5Q9H2C1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LHX5Q9H2C1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LHX5Q9H2C1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LHX5Q9H2C1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LHX5Q9H2C1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LHX5Q9H2C1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms