Protein–RNA interactions for Protein: Q9H223

EHD4, EH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4Q9H223 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EHD4Q9H223 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EHD4Q9H223 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EHD4Q9H223 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EHD4Q9H223 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EHD4Q9H223 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EHD4Q9H223 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EHD4Q9H223 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
EHD4Q9H223 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EHD4Q9H223 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EHD4Q9H223 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EHD4Q9H223 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EHD4Q9H223 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
EHD4Q9H223 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
EHD4Q9H223 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EHD4Q9H223 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EHD4Q9H223 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EHD4Q9H223 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EHD4Q9H223 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EHD4Q9H223 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EHD4Q9H223 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EHD4Q9H223 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EHD4Q9H223 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EHD4Q9H223 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EHD4Q9H223 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EHD4Q9H223 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EHD4Q9H223 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EHD4Q9H223 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EHD4Q9H223 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EHD4Q9H223 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EHD4Q9H223 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EHD4Q9H223 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EHD4Q9H223 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EHD4Q9H223 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EHD4Q9H223 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
EHD4Q9H223 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EHD4Q9H223 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EHD4Q9H223 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EHD4Q9H223 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EHD4Q9H223 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EHD4Q9H223 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EHD4Q9H223 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EHD4Q9H223 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EHD4Q9H223 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EHD4Q9H223 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EHD4Q9H223 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
EHD4Q9H223 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EHD4Q9H223 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EHD4Q9H223 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EHD4Q9H223 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EHD4Q9H223 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EHD4Q9H223 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EHD4Q9H223 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
EHD4Q9H223 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
EHD4Q9H223 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EHD4Q9H223 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EHD4Q9H223 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EHD4Q9H223 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EHD4Q9H223 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EHD4Q9H223 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EHD4Q9H223 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EHD4Q9H223 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EHD4Q9H223 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EHD4Q9H223 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EHD4Q9H223 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EHD4Q9H223 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EHD4Q9H223 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EHD4Q9H223 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EHD4Q9H223 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EHD4Q9H223 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EHD4Q9H223 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EHD4Q9H223 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EHD4Q9H223 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EHD4Q9H223 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EHD4Q9H223 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EHD4Q9H223 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EHD4Q9H223 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EHD4Q9H223 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EHD4Q9H223 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
EHD4Q9H223 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EHD4Q9H223 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EHD4Q9H223 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
EHD4Q9H223 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EHD4Q9H223 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EHD4Q9H223 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EHD4Q9H223 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EHD4Q9H223 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EHD4Q9H223 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EHD4Q9H223 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EHD4Q9H223 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EHD4Q9H223 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EHD4Q9H223 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
EHD4Q9H223 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EHD4Q9H223 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EHD4Q9H223 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EHD4Q9H223 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EHD4Q9H223 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EHD4Q9H223 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EHD4Q9H223 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
EHD4Q9H223 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms