Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W5

CCDC8, Coiled-coil domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC8Q9H0W5 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC8Q9H0W5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC8Q9H0W5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC8Q9H0W5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC8Q9H0W5 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC8Q9H0W5 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC8Q9H0W5 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC8Q9H0W5 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC8Q9H0W5 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC8Q9H0W5 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC8Q9H0W5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC8Q9H0W5 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC8Q9H0W5 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC8Q9H0W5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC8Q9H0W5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC8Q9H0W5 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC8Q9H0W5 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC8Q9H0W5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC8Q9H0W5 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC8Q9H0W5 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC8Q9H0W5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC8Q9H0W5 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC8Q9H0W5 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC8Q9H0W5 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC8Q9H0W5 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC8Q9H0W5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC8Q9H0W5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC8Q9H0W5 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC8Q9H0W5 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC8Q9H0W5 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC8Q9H0W5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC8Q9H0W5 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC8Q9H0W5 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC8Q9H0W5 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC8Q9H0W5 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC8Q9H0W5 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC8Q9H0W5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC8Q9H0W5 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC8Q9H0W5 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC8Q9H0W5 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC8Q9H0W5 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC8Q9H0W5 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC8Q9H0W5 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC8Q9H0W5 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC8Q9H0W5 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC8Q9H0W5 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC8Q9H0W5 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC8Q9H0W5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC8Q9H0W5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC8Q9H0W5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC8Q9H0W5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC8Q9H0W5 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC8Q9H0W5 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC8Q9H0W5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC8Q9H0W5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC8Q9H0W5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC8Q9H0W5 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC8Q9H0W5 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC8Q9H0W5 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC8Q9H0W5 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC8Q9H0W5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC8Q9H0W5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC8Q9H0W5 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC8Q9H0W5 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC8Q9H0W5 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC8Q9H0W5 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC8Q9H0W5 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC8Q9H0W5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC8Q9H0W5 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC8Q9H0W5 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC8Q9H0W5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC8Q9H0W5 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC8Q9H0W5 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC8Q9H0W5 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC8Q9H0W5 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC8Q9H0W5 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC8Q9H0W5 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC8Q9H0W5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC8Q9H0W5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC8Q9H0W5 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC8Q9H0W5 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC8Q9H0W5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC8Q9H0W5 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC8Q9H0W5 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC8Q9H0W5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC8Q9H0W5 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC8Q9H0W5 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC8Q9H0W5 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC8Q9H0W5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC8Q9H0W5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC8Q9H0W5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC8Q9H0W5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC8Q9H0W5 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC8Q9H0W5 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC8Q9H0W5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC8Q9H0W5 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC8Q9H0W5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC8Q9H0W5 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC8Q9H0W5 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC8Q9H0W5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms