Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT8

NIF3L1, NIF3-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIF3L1Q9GZT8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NIF3L1Q9GZT8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NIF3L1Q9GZT8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NIF3L1Q9GZT8 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NIF3L1Q9GZT8 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NIF3L1Q9GZT8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NIF3L1Q9GZT8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NIF3L1Q9GZT8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NIF3L1Q9GZT8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NIF3L1Q9GZT8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NIF3L1Q9GZT8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NIF3L1Q9GZT8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NIF3L1Q9GZT8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NIF3L1Q9GZT8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NIF3L1Q9GZT8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NIF3L1Q9GZT8 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NIF3L1Q9GZT8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NIF3L1Q9GZT8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NIF3L1Q9GZT8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NIF3L1Q9GZT8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NIF3L1Q9GZT8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NIF3L1Q9GZT8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NIF3L1Q9GZT8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NIF3L1Q9GZT8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NIF3L1Q9GZT8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NIF3L1Q9GZT8 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NIF3L1Q9GZT8 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NIF3L1Q9GZT8 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NIF3L1Q9GZT8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NIF3L1Q9GZT8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms