Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR1EQ9GZS1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR1EQ9GZS1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR1EQ9GZS1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR1EQ9GZS1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR1EQ9GZS1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR1EQ9GZS1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR1EQ9GZS1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR1EQ9GZS1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR1EQ9GZS1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR1EQ9GZS1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR1EQ9GZS1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR1EQ9GZS1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR1EQ9GZS1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR1EQ9GZS1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR1EQ9GZS1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR1EQ9GZS1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR1EQ9GZS1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR1EQ9GZS1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR1EQ9GZS1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR1EQ9GZS1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR1EQ9GZS1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
POLR1EQ9GZS1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
POLR1EQ9GZS1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
POLR1EQ9GZS1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
POLR1EQ9GZS1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
POLR1EQ9GZS1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR1EQ9GZS1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms