Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZR2

REXO4, RNA exonuclease 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO4Q9GZR2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
REXO4Q9GZR2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
REXO4Q9GZR2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
REXO4Q9GZR2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
REXO4Q9GZR2 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
REXO4Q9GZR2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
REXO4Q9GZR2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
REXO4Q9GZR2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
REXO4Q9GZR2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
REXO4Q9GZR2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
REXO4Q9GZR2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
REXO4Q9GZR2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
REXO4Q9GZR2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
REXO4Q9GZR2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
REXO4Q9GZR2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
REXO4Q9GZR2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
REXO4Q9GZR2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
REXO4Q9GZR2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
REXO4Q9GZR2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
REXO4Q9GZR2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
REXO4Q9GZR2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
REXO4Q9GZR2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
REXO4Q9GZR2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
REXO4Q9GZR2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
REXO4Q9GZR2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
REXO4Q9GZR2 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
REXO4Q9GZR2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
REXO4Q9GZR2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
REXO4Q9GZR2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
REXO4Q9GZR2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
REXO4Q9GZR2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
REXO4Q9GZR2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
REXO4Q9GZR2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
REXO4Q9GZR2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
REXO4Q9GZR2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
REXO4Q9GZR2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
REXO4Q9GZR2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
REXO4Q9GZR2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
REXO4Q9GZR2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
REXO4Q9GZR2 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
REXO4Q9GZR2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
REXO4Q9GZR2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
REXO4Q9GZR2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
REXO4Q9GZR2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
REXO4Q9GZR2 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
REXO4Q9GZR2 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
REXO4Q9GZR2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
REXO4Q9GZR2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
REXO4Q9GZR2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
REXO4Q9GZR2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
REXO4Q9GZR2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
REXO4Q9GZR2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
REXO4Q9GZR2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
REXO4Q9GZR2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
REXO4Q9GZR2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
REXO4Q9GZR2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
REXO4Q9GZR2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
REXO4Q9GZR2 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
REXO4Q9GZR2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
REXO4Q9GZR2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
REXO4Q9GZR2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
REXO4Q9GZR2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
REXO4Q9GZR2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
REXO4Q9GZR2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
REXO4Q9GZR2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
REXO4Q9GZR2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms