Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K1

SLC39A8, Zinc transporter ZIP8, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A8Q9C0K1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC39A8Q9C0K1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC39A8Q9C0K1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC39A8Q9C0K1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC39A8Q9C0K1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC39A8Q9C0K1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC39A8Q9C0K1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC39A8Q9C0K1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC39A8Q9C0K1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC39A8Q9C0K1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC39A8Q9C0K1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC39A8Q9C0K1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC39A8Q9C0K1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC39A8Q9C0K1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC39A8Q9C0K1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC39A8Q9C0K1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC39A8Q9C0K1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC39A8Q9C0K1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC39A8Q9C0K1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC39A8Q9C0K1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC39A8Q9C0K1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC39A8Q9C0K1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC39A8Q9C0K1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC39A8Q9C0K1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC39A8Q9C0K1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC39A8Q9C0K1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC39A8Q9C0K1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC39A8Q9C0K1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC39A8Q9C0K1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC39A8Q9C0K1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC39A8Q9C0K1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC39A8Q9C0K1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC39A8Q9C0K1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC39A8Q9C0K1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC39A8Q9C0K1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC39A8Q9C0K1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC39A8Q9C0K1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC39A8Q9C0K1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC39A8Q9C0K1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC39A8Q9C0K1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC39A8Q9C0K1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC39A8Q9C0K1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC39A8Q9C0K1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC39A8Q9C0K1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC39A8Q9C0K1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC39A8Q9C0K1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC39A8Q9C0K1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC39A8Q9C0K1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC39A8Q9C0K1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC39A8Q9C0K1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC39A8Q9C0K1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC39A8Q9C0K1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC39A8Q9C0K1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC39A8Q9C0K1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC39A8Q9C0K1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC39A8Q9C0K1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC39A8Q9C0K1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC39A8Q9C0K1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC39A8Q9C0K1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC39A8Q9C0K1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC39A8Q9C0K1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC39A8Q9C0K1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC39A8Q9C0K1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC39A8Q9C0K1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC39A8Q9C0K1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC39A8Q9C0K1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC39A8Q9C0K1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC39A8Q9C0K1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC39A8Q9C0K1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC39A8Q9C0K1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC39A8Q9C0K1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC39A8Q9C0K1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC39A8Q9C0K1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC39A8Q9C0K1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC39A8Q9C0K1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC39A8Q9C0K1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC39A8Q9C0K1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC39A8Q9C0K1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC39A8Q9C0K1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC39A8Q9C0K1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC39A8Q9C0K1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC39A8Q9C0K1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC39A8Q9C0K1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC39A8Q9C0K1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC39A8Q9C0K1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC39A8Q9C0K1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC39A8Q9C0K1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC39A8Q9C0K1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC39A8Q9C0K1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC39A8Q9C0K1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC39A8Q9C0K1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC39A8Q9C0K1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC39A8Q9C0K1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC39A8Q9C0K1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC39A8Q9C0K1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC39A8Q9C0K1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC39A8Q9C0K1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC39A8Q9C0K1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC39A8Q9C0K1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC39A8Q9C0K1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms